Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN26227
CCTCACACCACTCCCACCGCCGCCGGAACACGACGGCTGAGGTTTCAATTGGTGCACTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTTCTTGTTGGTGT
TCTAAATCAAGCTCCTTTTTGAAATTAAGTATGATTTTCTCCCAATTGGATTCCATATCTCCATCCCTGTCTTTTAGTTTGGAAATTAAACCGT
CAATTACTGCTGGTGAAGGTGGCCAGAAGCTGACGTCATGTGAATTTGAATTTGAATTAGAATTAGTGCATTTTGAAAGATGGTTTGATTCGGA
TTTTGGGTGTTTGGAAACTGGGATTGATTTATCGAGCATTGTTAATTATTGTGAAAAGTGTGTTTGAATTA

Primers for UN26227 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GGCTGAGGTTTCAATTGGTG 60.49520ACACCCAAAATCCGAATCAA 60.1720258 35292
2GGCTGAGGTTTCAATTGGTG 60.49520AACACCCAAAATCCGAATCA 60.1720259 35293
3GGCTGAGGTTTCAATTGGTG 60.49520TGGAATCCAATTGGGAGAAA 60.24420115 35149