Simple sequence repeat (SSR)
>UN25378 CTTGGGTACTAAAGCTATCCAAACTAATAACATTTTTTATGTGATTAAAAGATTCTTTTTGTGGGATTTGAGATATGAGTACTACCGAATACGC GATACATTCGATGTTGGTTTTGTGTGGTGTGAAAAGATGTGTGAGTTTAGGGACTAAAGATGGGTGTTTAAGGAGGTTTTTTAGGGTGTTTGTT TTTGTGTCTGGTAAGTGTTTGATGAAATGCTCCTGAGAAGATGTTGTGGGGTTTGATGGGATTTGTGGGACTATGTTTGTGGGTTTAAGGTGGT GGTGGTGGTGTTGTGTTGTGGTGGTGGGTTTAAGGTTGGTGAGGAGTTTGGGGTTTGGAGTTTTGTACGGTGG |
Primers for UN25378 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | ACGCGATACATTCGATGTTG | 59.572 | 20 | ACCTTAAACCCACCACCACA | 60.126 | 20 | 228 | 91 | 318 |
2 | TCGATGTTGGTTTTGTGTGG | 60.404 | 20 | ACTCCAAACCCCAAACTCCT | 59.834 | 20 | 242 | 102 | 343 |
3 | ACGCGATACATTCGATGTTG | 59.572 | 20 | ACTCCAAACCCCAAACTCCT | 59.834 | 20 | 253 | 91 | 343 |