Simple sequence repeat (SSR)
>UN24969 CTCAGCTTTGGCGCGGGTGGTGATAGCTTATGTACTGTACGAAAACTTGGATATGTTGCACGTATGGGTAACGACGGTGGTGGTGGTGGTGGTG TTGATGGCGGTGGTGGATCGAAGAACTTATAGTGCGGACCTTGGCTAAGCTTAGGCGCTGGTGGCGGTTTTGGAAGCTTTCTTAGCATTCTTCT TCGACCAAAATATATATCTCCTAGAGGCGATTCGAATGAAGCAGATTTCGCTCGAAAGACATGATCA |
Primers for UN24969 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GCGGGTGGTGATAGCTTATG | 60.49 | 20 | GTCTTTCGAGCGAAATCTGC | 60.103 | 20 | 236 | 13 | 248 |
2 | GCGGGTGGTGATAGCTTATG | 60.49 | 20 | TTAGCCAAGGTCCGCACTAT | 59.73 | 20 | 130 | 13 | 142 |
3 | GCGGGTGGTGATAGCTTATG | 60.49 | 20 | AGCCAAGGTCCGCACTATAA | 59.73 | 20 | 128 | 13 | 140 |