Simple sequence repeat (SSR)
| >UN20220 CCAAACTCGTGCACCTTTGTTGGGATCTCGTATCTCAGCTGCCCATTTTCCCCATGGTCGCTGTCTAACGCCTCTGTAATGTCTTTTCACAGTT GGTTCTTGTTGACGATAATTATCAGTTGGTGGTGCAATTTGTTGTTGTTGTTGTTGAGGTATTACCATCATCGATGGAGGTGGCAACAACGTAG AGTATTCGGGCACGAAACCGCGATAAGTATCATCTCTAGGAGTTGTTGTTGCGACCATCTGATGAGGCTGGTTCGTCCACTGGTTTGTGTAGCT ACTACTTTGACTTTGACTTTGAAGATCATGCTCATCTTCTATCTGTTTATCCATGAAGCGTTCGTTATCCATGGCTTGTTT |
Primers for UN20220 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | GTGCACCTTTGTTGGGATCT | 59.973 | 20 | CAGATGGTCGCAACAACAAC | 60.16 | 20 | 241 | 9 | 249 |
| 2 | CACCTTTGTTGGGATCTCGT | 59.966 | 20 | CAGATGGTCGCAACAACAAC | 60.16 | 20 | 238 | 12 | 249 |
| 3 | CGTATCTCAGCTGCCCATTT | 60.235 | 20 | ATCAGATGGTCGCAACAACA | 60.12 | 20 | 223 | 29 | 251 |