Simple sequence repeat (SSR)
>UN20082 CTTTATCATAACTATCTTCTCGCTTGATATTTTGTACAAAACACATGTGTTCTCTTCACATCGCTCATCATACTCGTACCTTGATACATAAATC ATTCCGTGTTTCGATTTAGATCCGTTGGTTGTACCGCTTGTACATACAACTTTGCCATCCCTTTTTATGAACCTTTATTATTTTTTTTTAATTT GAAGGTGTGTGTTTTTGTTTGTGTGTGGGTTTGCAGTGGGTGTTTGATGATGATGATGTAAAAAGTGACGGTGGAGAGAGGTGGAAAGAATTAG CACGCAAAATTAAGTGATGATGATGTAGATTGAAGGAGTAGTTGATGTGGGCTATGATTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTACGAGATATTCAGAT AAGGGGCGGCGGCTAGGGCTTTGCTTTGGG |
Primers for UN20082 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GCAGTGGGTGTTTGATGATG | 59.967 | 20 | GCCGCCCCTTATCTGAATA | 60.009 | 19 | 166 | 221 | 386 |
2 | TGCAGTGGGTGTTTGATGAT | 59.967 | 20 | GCCGCCCCTTATCTGAATA | 60.009 | 19 | 167 | 220 | 386 |
3 | TTTGTGTGTGGGTTTGCAGT | 60.049 | 20 | GCCGCCCCTTATCTGAATA | 60.009 | 19 | 181 | 206 | 386 |