Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN16625
GTTGTTCGTGTAACAGGATTCATGTTCTTTGAAGGGCGTCATTTAAGGTAAGCGTGAAGTTTTTTTGAGGGCTCGTGATGATGATGATGATGAC
CATGAACATGCTTATGATGTTCATGTCTTTGATGATTATGACCATGTTCAGGCACATGAGTTTCATTATCCCCAAGATCAGTTCCTAGTTCATT
ATGACCATGTTGATGTTTGTGATTGTGACTGTGACCGTGACCATGACCATGACTGTGACTGTGTATCTGCGGACGTACAGGTGGCGGTGGTGGG
TTCAAATGAACGGGTGCAAAAGGTGATGGAGGTGAAGGAGGAATTCGTGATGATGGAAGATATGCACAGGCTTGATTTGCAAGGGCTAACT

Primers for UN16625 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTGAAGGGCGTCATTTAAGG 60.06720GTTCATTTGAACCCACCACC 60.07320265 29293
2TTGAAGGGCGTCATTTAAGG 60.06720CACCTGTACGTCCGCAGATA 59.7420243 29271
3GGCGTCATTTAAGGTAAGCG 59.74220GTTCATTTGAACCCACCACC 60.07320259 35293