Simple sequence repeat (SSR)
| >UN10101 TGATGGTGGGGGTGGCGGCTGCGGTGACTCTAATCGTGCTGGTGGTGGTGGTGGCACAGGGAAAGGCTCAGTTGGTGGTGGTGCCAATGGTTGT GCCGATGATACCATAAGTGGTGGTTGGGAAGTTGAGGTCGATGGAATGTTACTTGTTACATGCTGACCTGGCAGTATCCTCCGGGACGTTCCAA TGTCGGACGGTTCAGATGTAGGCCTAAATGGTCTCATATGAGGGGCC |
Primers for UN10101 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | GCTGCGGTGACTCTAATCGT | 60.428 | 20 | TTCCATCGACCTCAACTTCC | 60.05 | 20 | 123 | 18 | 140 |
| 2 | GCTGCGGTGACTCTAATCGT | 60.428 | 20 | TACATCTGAACCGTCCGACA | 60.112 | 20 | 191 | 18 | 208 |
| 3 | GCTGCGGTGACTCTAATCGT | 60.428 | 20 | CAACTTCCCAACCACCACTT | 59.861 | 20 | 111 | 18 | 128 |