Simple sequence repeat (SSR)
| >UN00989 TCTTGTACACTCAAGTTAGCAGCAAAGAGCATATCAGCATTACGCAAATATCAATAAACATTGCAGAAGCCACCAATGCATCTTCCTCAGCCTT TTCTATAACTCAAACCCTCATGGAAATGTTCCATTTCAACAAATTAGTTGTGCCATATTCGACTCGGGTGGTGCAAATAAATTTATCAAATCTG ATCAACCCCGGTTCGTAACATCATCAAGAAACCACATAATCATATAGCAGTCTTGTGAAATTAGAATGAATATGGATCAAGAAAGCCGCACGGA ATGTCTCAAGAGCTCAATATATACCCCACGTCATATAGTTGTGCTCATCACAAAATCGATTAGTAGGGAATAACATATGGCAAAGCACAAACAT CAACAGATTCTATGTGCTTAGCTTCAGACCATACCTGGACCTGAGGATCCTCTGTCGGTGGTTTCTTGCAAGTGGGTCCCTCTTTGCTGTTAAA TAACCATTCCTGGTTATCATCACCACACCATTGGTCCAGTTTTGGAACCGTGAGTATTCGGCTCAAGTATTTGGTATCAGGATGAGGTGGTTTC ACTGGTGGTTCAACGGGTACCGGTGGCTTCTTTTTTGGTACAGGCATTGATGGTGCTGCCACCTTGTTTATAACAGCAGGTGATGGTGGTGGTG GCGCCACTGCCTTGTTAACAAGAGCAGGAGGTGGTGGTGGTGGCGCCGCCACCTTGTTGAAAAGACCAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGTCGACAC CTTGTTGAAATGAGTAGGAGGTGGTGGTGCTGCCGCCACCTTGTTAACAACAGCAGGTGGTGGCTTAGGTCGGGGCACAAGTGGTGATGTTGAT GAACGGGGTGGTGTTTGGGTTACGGGATTAGGAATTGAAGGTGGTGGCTTGGGTGATGACAGCCGGGCTGCAATGTGATTAGGTTGTGGCTTGG TTGTAGGG |
Primers for UN00989 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | GGTGCTGCCACCTTGTTTAT | 60 | 20 | GCCACCACCTTCAATTCCTA | 59.933 | 20 | 279 | 616 | 894 |
| 2 | GGTGCTGCCACCTTGTTTAT | 60 | 20 | CAGCACCACCACCTCCTACT | 60.174 | 20 | 169 | 616 | 784 |
| 3 | CCAGTTTTGGAACCGTGAGT | 60.005 | 20 | CAGCACCACCACCTCCTACT | 60.174 | 20 | 279 | 506 | 784 |