Simple sequence repeat (SSR)
| >UN08609 TCATGATTGTTTATCCCCACAAAAGTACAAGAACCATCATAATTAACTAAACTACTTACCAATAATCAACAAATAAACTAACTTCCTTCTAATA TAAGTAACATTAAGTAAAAATTAGACCAATAACAACAAGAAGAACAAAACAACATCCTCCTAATAATAGAACTACTACTAGTAATAATAACATC TCAACAAGATGAAGATGACCCTTTAATCACATTCCCACTAACAAGATGTAGATCATGATTGTTGTTGTTCCCGTTGATGACGTCATCATTGTGA CTAACATTGTTGTTGTTAATGTTTCTTGACATAATAAAATCAATACCATCATGACCATTAATGTTGTTAACGTTAATAATGTTGTTGTTACTAC TAGCATGACCGTGACCAAGATTCTCATTCTCATTGTTGTTTTTGTTAGTACTTTTGTTGTTATGCATCCATACCTTAAACACATTGCGATCAAC ACCAATCTCGTTACAAAAACTGTTTATCAGCTCCTCATCACGTTTCTGCATCTTCCATCCAACTTTTGAAGCTATTTCATGCATTTTCTCTTTT TGGGCCTGTGTGAACTTTGTTCTAAATCTTTTTTTTGCCACTTGGAGTGGTGGAGTAATGGTTATTGGTTTCTGAGCCAAGTGCAAGGAGCATA TGTGGAGCTGATGAAGGGTAGTAAGAAGATGAGATAGGTGGTGGTGATGATGGTGAGTTTAGTGGGCTAGTAGTGGTTGTTGTTAAGGGTGGTT GTGGTGGTGGTGGTGGTTGGTGACGGTGGTGAGGTTGGTATTCTAAAAGGTGTTGAATGGGTGGTGGTGATGGTGGTTGCTGGAAGTGGTCGTG TTCACGGCGGTGGAAGTTACGGTGGCAGCCGCATGCTGCGCATTTTAGTGAGGTGGGTAGTGATGGTGAGGAAGATGGTGACGGCATGAACTCA CCGCAGCCGTCGAGGGCGTGGCCTCCCATGGTAGCTGCATGGTTTTTTAAGCATTCTTTGTAAGTGACCACCACTGGTGGTGAGAGTGGTTGAT GGTGGTGGTGGTGGTTAAAGGGTTTGTGGCGTTTGAGTACACCGTTGGAGAAAGGTGGTGGAATGGGTTGCTTTGGTGGTTCGGATTCTGGATC AGGTGTTTTCACGGTGGTGGCTGAGGTGGTGGTGATGGTGGTTGATGGCGGTGGTGGTAGTGGTGGTGAGATCTCCATTGATGAGTTTTGCTTT TGGTTGAGAGAAATGAATTAGATTTGGAGATGTGGTTATTAAATGGATGGTTTT |
Primers for UN08609 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | CGCATTTTAGTGAGGTGGGT | 59.993 | 20 | ACCGTGAAAACACCTGATCC | 59.827 | 20 | 259 | 885 | 1143 |
| 2 | GGTGGGTAGTGATGGTGAGG | 60.238 | 20 | TTCCACCACCTTTCTCCAAC | 59.943 | 20 | 200 | 898 | 1097 |
| 3 | CGCATTTTAGTGAGGTGGGT | 59.993 | 20 | GGTGTACTCAAACGCCACAA | 59.615 | 20 | 193 | 885 | 1077 |