Simple sequence repeat (SSR)
| >UN07562 CCCCGATTGCCCTTATCAAACCCTCCGCTTCCCAGAGACTCATTATCTCCATGACATGAAGGAGCCGTTTCGCAGGCCCAGCTACCAATAACTT CAGATGCCAAAAGATCAGCTGTTCTAATAGTGTCTCCAGCTTCTGTATCTTCTTCAATAGGGTCCTTTGATTGGTGCAAATTCTCACCATTATC GACTTTAACCCCTTCCTCATCATCATCATCATCAATTACCATTGTATCGCCAACCAACTTGTTCAAGTCGACATTTTGGTCATGTCCCTGGGTT TCGGTTTCCATTATTTGTTCGGTTTCCATTATTTGTTCGTTTCCTATTGGTGCAGTATGGCCAGCATCGATATCAGATCCAAAAGCACCCTTAG CACTAGGCTCAACACTTGTAAATTCAGCTTCTTGTGTTTCTTCACAAGTTTCTTGATTTCGGGCATCACAGTCGTGCTTCTCAGTTACACTGGC TTCTTCATTTAATGTTTCCACTTGATTTTCGCCTCGGGTCTTGGTGGAAGTGCTGGAATCTGCTGCCTTCATGCTCCCACTGCATTGAGACCCA TTTGCTTCTTTACTTTGATGTATAGAATCTATCCGATTGCCATTATCAATATTAGGATTAATATCAACTGATATGTTCTCATAATTCTCCTCAT CTTCTAGTGTTCTCTGCATTAACTTTAACTGTTCCTGCTGTTTTGAAAACAAACTAGAGATTTCCTCAGTTGTTGAATAGAAAGACCGCAGCTG TGTTTCCCGAAGCATTATCCTTTCCCTGGCAGCTTTTAGCTTACGTTTTTCACAGTCAAGGTCCCTCATGGCACCATTGATCTCGAATTCAAGG GCTGAAACCTTAGCCCATGCTTCTTCCCTAGCTGCCTTTTCGCTTTCAAGTTCTTTTCTCAGTCTGCTAGTTTCATGCTCAAGTTCTTGCACCC TTTTTTTACTGACAGAAGAAACCCGCTGCTCTTGGGAAAGCTGGGATTCAAGCTGGCGGACCTTATTATCGGAGCCAACCAATTTCTGCCTAGT GTCTTCCAATTTGGATCTCAAAGTCTCTACCAATAAACATCTTTCTTTCTCCGACTCCTGAAGCTTATTAATAATTTCTTGCTGCTCATTTTCT CGCCTAAGAGATGCATCCGAGAGCCGCTTCAGTTCCTCCTGAGCTTCCGTTTTAACCCTCTGTATTGAGGCTGTCAAATTTGCTACAGCCTTTT CTCGATCCTCTTTTCTCTGTTCTCTCTCTTCATCTAGAAGATTCTTGAGTTCAATTATGGTTGCTTTCTGGCTACGCATTATCTCATCTGCTTC AGTACAGCTCTGCACCACTGCATTGTGTCTTTCATTAAGGTCCTCCAAAGCATATTTTTGTTCAGACGATATTTTATTAACTTCCACTAGTTCT TTCTGCTTTGCCTCTAACGAGCTACACATCTCCTTGAGTTCATAGCTTCATGTAGCTCAATGGTTGTACGGTGTTCATTACGTAATTGTTCAAT GGTTGCAACTTGATCTTCCAGTTGCTTCCTTAAATCCGTGTTTGACCGTTGAAGGCTCCGAAAATCATCAAGTGAAATGGGACCTTCGGAAGAA CCAATACCAATTCCTCTCAGCCTCACGGGTTCAGAGCCAAACTCATCTGCTTTTCTTTTTAGCGGCGAGCTGCTATCTGTTCCTGACGTAGGTC TGAGAACTTCTCGGAACACAAAAGCATAAGCAACTTCATGTTGAGGAGGTGCTGCGAATGATATAATATCTCCATGATGTAGTTTCGACTCGGG GCTGTTCTTATTTAACTTTTCCCAGTTGAGATACGTTCCATTTGTGCTGGTATCTCTCAGAAAGCCGCAGTTAAAGAGTCTATGACCCTCTTCA TCTTCTGTAGTAACTTTCTTCCTATATATTCTGCAATGCTGTTGACTTATTTGATTTGACAAAATCTGGAACCGCGTATCAGGTACAGTTCGGC CAATGACATGTTCATCCTTAGTCAGGAGCATATTTATTCCCTGACGTCTTTGTCTAGCTTTAGTACTAATAGCAGTAAGAACACCCCAAACATC AGGATCAGAATACTGCAACGCTTGATTGGCGATATTGGACGCAACTGACAGTATAAAATCCTCTGGAGTGGTTGACTTAGTCAACGGTTCTCCG TTATTAGGTTTAGGGTTTGATATAGGCGTTGTTTGAAGGTTGTTGTCTTGGTTGTTATTAGTAGCCATTGATTGATTTTGATTGGATTTGGGGA AATGAGGTTTAGGAGGCCTGGTTAATTTATTAATTTATTTATGGAGTGAGGGTGGTTTTAGCACCATAACT |
Primers for UN07562 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TAGGGTCCTTTGATTGGTGC | 59.933 | 20 | TGATATCGATGCTGGCCATA | 60.02 | 20 | 206 | 152 | 357 |
| 2 | TAGGGTCCTTTGATTGGTGC | 59.933 | 20 | TAATGGAAACCGAAACCCAG | 59.795 | 20 | 144 | 152 | 295 |
| 3 | TAGGGTCCTTTGATTGGTGC | 59.933 | 20 | GTGCTAAGGGTGCTTTTGGA | 60.249 | 20 | 228 | 152 | 379 |