Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN06967
GCAACAGTCTGAGTAGAATTGTGGCATGGGACTGTGCGTACAAACTCAAAAGGTTTAGTCCCTCTAGATTGCAGCTTACTCCTTACCCACTGGC
GACATTCTTCCATGTCAAGCTGTACACTCCCGAAATATGAACGTTTGGCAGTAAGAGGAAAACTGGAATTGTATATGCTGGTTATTGCTAGCCC
ACTCTTCATCGTACTGAATCTCATGTGGCCCAGGCTCAGATTCAACTTCGATAATCTGCAAAAAATTCCGCCTCGGAATACACTTATCGAGTGC
AAGAAATTTGGTAACTTGACCTCCATCCCCATGTTGAACTATAGCAGCAAATATTGCTTTGTAATTCCTAACTGTAGAAGGTGACATGCCTACA
CATAAGGAGTGTTTGCTCATTTGGTCCACGTGTTGAATGAGTTCCTGGCTTCATGTGACCCAAAAAAAATATATATCCATTGATATATATCCAT
CTTTCTATTTTATCTTCTTTAACATTATCTTGAGTCTGCGTGTTCGGAGCATACGTGGGTGATACTACATCTGGTCGATTAAATGCGCATTTAA
AGCACACTAAATGCTTTCGGTAATTAAAGAAATTACACCGAGGACAGTCCCACTCCCCATCAGCCAATTGTCTTTGCGGTCTCGACTCTTCACA
TTCAAGGCATTTAGCGTTCCTTGCAAAGCTCATGAAACTGCATTTTGGGCATATCCAATCACCTCTCTTCATTGTAATATTTGGTCCAAGATTT
CTTTCAGGATGAACAATAGGATTGTTTACAAAATTCAGTATGTACTTACTTCATCAAGTCCACTGAAGTTGCTTCATTTGATCCCTCCGCCTAA
TGGTTAACTGTGTGATTTTTTTTAATGATGATGATCGTGATAAGATGATGATGATGATGATTATTATATATGGATGATTGGGGTGATCGGTGAT
GAAACAACCTGTGCAAACCATATGCAGAAATGGTGGTGATCGGTGATGATTATAGCGGTAAATGGTGGTGATCGATGGTGATTACGATTGCAGA
TGGTGGTGATCGGTGATGATTACCGGCGGTAGATGGTGAATACTGTGGTGGTTTCTGGG

Primers for UN06967 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTGCTTCATTTGATCCCTCC 60.01420CACAGGTTGTTTCATCACCG 60.00120133 821953
2TTGCTTCATTTGATCCCTCC 60.01420TGCATATGGTTTGCACAGGT 59.99520146 821966
3TTGCTTCATTTGATCCCTCC 60.01420ATCACCGATCACCACCATTT 60.05720167 821987