Simple sequence repeat (SSR)
>UN06638 TGTGGGATGAGAAACTGATCGTTGTCTCGGGTCGGGTAGTTATGAAGTGGGTTGAGGTTGTTTTGGTGGAAGACTTGAGGTAAGGTACTCCATG ATGATGCTTGTTGATGATGTTGATGCATGATTGGATTAATATTTTCTGAGGATGATGATGATGGAAACATTAACCTAGTGTTACTATATGAATA ATCATTAATACTACCCATGTTTTGTTGTTGTTGTTGATGGATTTCTTGAAGCACTAATTGTTGTTGTTCTTGAAACCTTTGAATATTTTGTTGT TGTTGTTGTTGATGATGATGATCACCTTCTTCTATTACTACCTCTTCTTCTCTTTTAGCACACATAATAGTTTAACTCACCACCCCATGTATAG ACATGGTTAGACTCTTCAT |
Primers for UN06638 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TGATGTTGATGCATGATTGG | 58.862 | 20 | ACATGGGGTGGTGAGTTAAA | 57.768 | 20 | 264 | 109 | 372 |
2 | TGATGTTGATGCATGATTGG | 58.862 | 20 | TGTCTATACATGGGGTGGTGAG | 59.734 | 22 | 271 | 109 | 379 |
3 | TGATGTTGATGCATGATTGG | 58.862 | 20 | TGTCTATACATGGGGTGGTGA | 58.709 | 21 | 271 | 109 | 379 |