Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN06540
TGAAATTGTAGTGTCTCTCTTTCAAGAATTTTTATTTGATCATCATATGAACCACAAAGACGCCCGGTCCTTGAGTTCTTATTCGGGGGAAGAA
TCGTCTGTGCTGAACCACGAGTGAACATCCTATGACCCTCTAGGGTGTAAACCTCCAACAGATTTTGAATTCTTTGATCAAAAGCAACCGCCTT
TCCCATCTCATAGTCTTTTACAAGCACTTGTCTCTCAGCATGGCCCTGATCCACCAAGACATTCAGTACTGTGGGACTATCAGATTGTATAACT
GATAGCGTTGTTGGGTGATTTGTATGGGGAAGCTTTTGACTTTCAATTTGAAACCTTGGTATAGAAAAATCAAATATAATGATCTTAAGGTTGT
GATAATTTGCTTCTCGAGCGCATGATCTCAGTAACAAAAAATCTTTATGATCTGTCACTATGAAAGAATTAAACAGCTTCCCGATCGCATGTTC
GACTGCAACAGCCCATTTGTCACCATGAGTTAATGCCAAGTGTGATCCTATAGGGCCAATAGGGGGTTTTCTGAATCTGCGGTGGTTTCTCTCA
ATAACCTGCAGAAGATTGGGAACTCCACGTCCTCCAAATGCTGTGACCTTGTGTGTCTGATTTAGACGCAGGGTCCGAATGCGCCCCTGACTCT
CATTGGCCTTATTCTCAAGATCATTTAGCTCGGAAATTATATTTTTAAGTTCATCCCTCGCTGCTCCCAGCCTTTCTGATAAATCCTCCTCGAT
GTTCTTCAGCCTCTGACATTCTGATTCAGCATCCCTTATCTCATCTTGAAGGTCCTTTATTTTGTTCTCCATTTCAAATTCTTCAGCCTGTGTG
TCTTTAATTTGTTGCTCATTTGCATCGTTGATTTGTTGCTGAAGTGACTTTATCTGTCTTTCCATCTTAGCAATGTTGTTACTTCTGCGATCAT
ATTCTTGGTGCAGCTCAATTTTCTCCCTTTTCGCCTTAGAAACTTTTTGTTCCAGTTCGCTCTGCCTTTTTTTGGCCTTCGAAGTACTTTCCAT
CAAGACAGCACTTTGAGCTTTCTTTTTGTTAAGAGAATCCTGCAAGTCTGCAACTTTTGCAATTTGTTGATCAATTTTAGCTTGACATTGAGGT
ATCCGACCTTCCAGTTTTTTAATCCTTGCAGTATCTTCTTGGATTTTTTTGTCTATGTCATATACCATTGACCATGCACATTTCTTTCTTAACA
GCTGAATCTGCTGAGAAATTTCTTCTATATGCTCCATGCTTTTAATTTTTCCTCGCAATTCATCTAGTTCCTTCTCTATAGGTGCTATTGACCT
TTCCAACTCAACAACCTCGCCATTAGCCTTGTCAAGATTGTCCCTGACACTTTTGAGCAGATCATCTACCTGACTTAAAAGTGTGGCCTTGAAA
AAGAACTTAAACTTATCTTTGTCATTTCCTGAATGCAAAAACTCTCTGCTCTTGTCCTGGCTCATTACTACACAAGGATTTTCAACATCAATAT
TAAAATGTTCCACAAGCTCACGGATGTCTTCTCTTCGGGTAGCTACTTTTTTTCCTTGTTGATCTTTAAGAACACTAGTACTGCTGGATTCTGT
GATCCTTCGCTCTACGATTATGACATCTCCAAACACATCATGCTTAAAAGCATCCTCCCCCCGATTCGTAATTTCCACATGTACAAGGGCGTAG
CTACAACCAGTCTTAATAAACTCCTTCAACGTAGTGGCCCTATCGGTACTCTTGGCACGACATCCAAACGCAATACACAACGCCGTAAGGATCG
CACTCTTTCCACTGCCGTTTTGTCCGGTGATGAAATTGACATGATCAGCGAGATTAATTTCCATATGACTATGACACATGAAATTCTCTACTCG
GATTTTGCTGATTATGCCTGCTAATAAACCCTTACTAGGGTTTGACATCTTACTTTTTTTAGGGTTTCTTTTGTGAGGTGTTTGGGTGATGATG
ATGATGATGTGTTTAATTAGTTAATAATTGGTGTTTTGGTTTTGGTTTTTATGATTGGGGAGGAGATTAATGAGTGGTTTTTGTAGATTTGGGG
GAAGAATTGGCGGG

Primers for UN06540 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTGTCCGGTGATGAAATTGA 59.920CCAATTCTTCCCCCAAATCT 60.12420273 18062078
2CGGATTTTGCTGATTATGCC 60.42420CCAATTCTTCCCCCAAATCT 60.12420200 18792078
3TGTCCGGTGATGAAATTGAC 59.34820CCAATTCTTCCCCCAAATCT 60.12420272 18072078