Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN05598
TCACCCGGTGATGTCACCTTCTCGCCCGTCAAGTAAACTCCATCAATCTCCTCCCTCACGAATCTATATAATGGGTACGATCTACATTCCTTGA
TCCTGTTGGGGATAGCCAATGTACCATTCTCAAATGCGACTCTGACTGCTTCAACTTCTTTAGGTAAAATGGCGTTTATCTCTTCTTCAAAAGT
AGCGATCTTTTGGAAGATGGATGTGTTTGTGTTCTTCTCGGTTTCACCATTGGTTAAAGCATGGTCGACTAGGACTTGTCTGAGCTTTTGCATT
AATGGGTATGTGGCGAGACACACGTCATCAATGTATGCAAAGACATACTCGCGATCAACGACTCTAAGCAAGTCCTTTTCACAGAACCTTGAGG
GGTGAAGCTCCCCTGTCACACCCGTGGTTAGGACTTTTTTGGCTACATGGCTCACGGTGTTCTTAACAGTGGCTTTCAAGTTTTCCTCCAAGTG
TCGTAAGTCGATGGCTTGGCATAGAGCTACCAAATATGTCGAGGACATGAGCTTCAAGATGTCAACAGCTTCGGATGTTTTACGGGCAGAAATT
AAACCCAAAGAGTTTACATCTTGGTTGTGTTGTTCGGCACTTTGGACATGGTTAGTAACAGGGTTGGCAAGAAATTGGAGTTCAGAACAGTAAG
ATGCCATTGCAATTTCAGCACCTTTGAAACCATAATCCAAGCTAGGATTCCGTCCACCAGAGAGATTGGAAGGTAACCCATTGTTGTAGAAGTC
ATTAACGAGCTCGGAGAATTGGGCAAACATGAGTTTACCTATTGCAGCAATAGCCAAACGTGTGTTGTCCATGGAAACACCAATCGGGGTCCCT
TGGAAGTTGCCACCGTGCAAGGCCATGTTCCTTGAGACATCGATCAAAGGGTTGTCGTTCACCGAGTTAATCTCTCTTTCAATCATTTTAGTGG
ATGATCGGATGACCTCAATTTGTGGGCCTAACCATTGAGGTGAAGTCCTAAGAGCGTAACGGTCCTGTTTAGGTTTCTGTAACGGGTCCATTTC
ATGGACCTTTTGTGCTGCCTTAACATAATCACTTCCATCCAATATATACTCCATGATCGCTGCTGCCTCGATCTGGCCAGGGTGGTGCTTTAGT
TTGTGTGTCAAGTGGTCCGTAAACTCGGGCTTTCCTTGCATAACCTCGGCGAAAATGGCGGACAAGACTTCTGCTAACAATGAAAGTACATTGG
CTTCAAAAAGGACCATTGAGGCCATTCCTGATCCCACAGCGGTACCGTTAACAAGTGCTAGACCTTCTTTAGGCTGTAGCTCGAAGAATCCACC
CTCAACACCGGCTAGGCTAAAAGCCTTTTCGGCATTAAGGATTTGTCCATCGGGACCGACAGCTTTTGAGTTGGGTCGGCCGGTCAGAAGTCCA
GCAATGTACGACAATGGGACAAGGTCTCCGGATGCGGTGATGGTACCACGAAGGGGCAAACAAGGGGTAACATTGCTATTGAGGAACTTGGTGA
TTGCTTCCAAGATCTCAAAACGGATACCCGAGTAACCCTGGAGGAGGGTGTTAATTCTAACAAGCATTGCCGCTCGTGTTGCTGAATGTGGGAG
AGTGTGACTTGCTTCGGTGCCATTGCCGAAAATTCCAGCGTTCAAAAATCTAATGAGCTCCTTTTGAAGAGCACCACCATTCTTGGTTCTTCGG
TGCGAGGTCGCACCGAAGCCAGTGGTGACACCATAACTGTCAGTCCCTTTACCCATACTTTCCATAACCCAATCACTGCTAGCTTTAACTCCAG
CTCTCGCAGACTCTGACAACTCCACTTTAACACTGGCGTTGTCAGATGCTGCGATCCCCGCAACTTGGGAGACAGTTAATGTCTCCCCACCTAT
CTTAACAATAGGGTTTCTAAACTCCTTAACCATTTTCTTAACCTCATCTAAATGACTCCCTGTCAATGCTTCAGCAGCAACACCCCAGTTTAAT
GGATCCTTAATGCATAAATCATTAATGTGACCATTACCATTAGTACCATTAGCATAGACCCCGTTACCGTTTTCCATTGTTGTTTTATTTATTT
ACTGATTTGGTGCAAAAGACAATGAGCAAACAAAGAACAATCTTTATTGTTGTTGTTGTTGTTATTAATTCACACACTAGACTCACACTCTTTG
TGTGTGAAATAATAATGTTTTTTTTTTGAG

Primers for UN05598 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCGTTACCGTTTTCCATTGT 59.72420CAAAGAGTGTGAGTCTAGTGTGTGAA 59.94626128 20352162
2CCGTTACCGTTTTCCATTGT 59.72420CACAAAGAGTGTGAGTCTAGTGTGTG 60.35126130 20352164
3CCGTTACCGTTTTCCATTGT 59.72420CACACACAAAGAGTGTGAGTCTAGTG 60.35126134 20352168