Simple sequence repeat (SSR)
| >UN94202 ATTAAAAGCTGAGATTACAATATAAGTAATTACTGATTAACTAAAGAAAACGATTAAGATGACAAGTAAATAAAAGGCCAAAACTTCTCTAAAA CATGAGAAATTGGACAAGAAAATATGTGACTGAAATGGTCTTTAAATAGCAGAAGTTTGAGAGGCCATGGGATTCCTTTGAGAAGAGCCTAGAA GGCCATTGCTGAGCCACACAATCATTCCATGATCACTCCAGCCAATCACTGAGCTCCATTTGCACATGTGAGGTGTTAAAGCCAATGAAATGGC TCCATTTGTCCACGTAGGCCACTCCTCTGACAGGTCATAGGTTATCTAGAAGCTTGATAAGATTCTAAGTACCAAGTTTTGTGTTTGGATAATT GGATAATGGTGTACGGGGTGTGTTTGTTTGGGGAAGAAGCACAGGGGAGCGTTTGGTATAAAAAATATTAGTTTGAAAGCTTTGACCGGGTGGG TTTAGTTGTTTGACCAGGGTATAAAACGGGTTCTTGGGTGGATTCGGGTATGAGGTGTAATTTCGGGTCAAGGGGTTTAAAGTGTTAACTGGAT TGGGTGGCCGGGTATTGGTTATGTGATTGGGTCAGGATAATAGGATTTTGGGCCATGGCATATGTTATTGGATCATGGATTGGATATGTAGTTA TTAAGTGGATAATGGATTTGGCATAGACTTGGATAATAACCATAGGCAAAATTAGGGACCAAATATGTTAAAACTGAATTTTGAGGGGCCAAAC TTGTGCATTCTGAAATTAACTTCCAAGGACCATTCTTGTCAACCATTAATAGACCAGGGGCTGAATTTGCAATTTTCTGAAACTTTAAGGACCA TTTCTGCCAATTCTCAAAGTTGAGGGGCCAATTCTGCCAATTCTTCAAACTTTGATCAAATCTTCACAAATCATCCTCAGAGATTAGAAATCAT CATAAATGCTCAATTCTGACCCTCCGGCTCAGCTTAAGCTCTCTTGATCTCTCGTGCTCGGTTTTCTGTCTGATTTGGCTCCTTTTTGCGTGTT TTTACATATCCATACCTGCACAAGCACAAACTCAAGAAAACCACAAATATTAGCAATAAACGGCTCTTTCTTGGTTATTTTGGGTCTATTTGAT AATGAAAATGTATGTGTTAAAGCACATACCAATACGTGTAACACCCCCAATTTCGTGATACGCAGCGGAATTCAAACTGGGTGTTACTTCATGG CACAACAGTCATAACAATAGAAAACGAACTCTAATGGAGTCGTTTTAAAAGATTTATCATTCGATTTATATAAATATCAGAGTTTACAAAAATG AGGTCCCAGTTGGTTTCACGGTTTACAAAATACATTAAATGGGTTTTCGAATGATAATAAAATTTATAGCCTTCTTGAGTATCCGTGCTCCTCC GTGCCAGCCTCGTACAATATGAACCACAAACGAGAGAGATGAGGAGGGATGATGGTGCGTCTATGGTGGTGATGGTTGTTGACACGGTGAGATG GTGGTGTCGCCGGTGTCGTCGATGATGATGATGCTGTTGTAGTTTGAAGAGAGAGAGAGAAGAGAAATTATCTTTCTCTTTGTTTTGGTGTTTG TGTGAATGAAGA |
Primers for UN94202 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TGTTGACACGGTGAGATGGT | 60.005 | 20 | CATTCACACAAACACCAAAACA | 59.386 | 22 | 120 | 1487 | 1606 |
| 2 | GCCTTCTTGAGTATCCGTGC | 59.843 | 20 | CATTCACACAAACACCAAAACA | 59.386 | 22 | 222 | 1385 | 1606 |
| 3 | TTGAGTATCCGTGCTCCTCC | 60.218 | 20 | CATTCACACAAACACCAAAACA | 59.386 | 22 | 216 | 1391 | 1606 |