Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN94005
CTGCAAAACTATAATTTGTGCTGCAAGAAGCATCAAGAGTAAGGTGAAAAATACATTTATTTCATCATCAAACCTTAGTTGGTAACAGCCTATA
CATATGCTAAAAAGCTAGAAAGTTAAAGTAAATAACCCGACGAGACGGGACAATTAACTAACTCTTAAGGATGGTTTCCAGTGCTTCGAAGAAT
AACGGGGCCATTTCGGGGCTTGGAGTTTTAACGGCACATTTAAGTCCAGGAACACCAATAACTGCTGTAAGTTCAATCAAGAAAGGGATTCCTT
TTGGGATTTTGGCTGATAGATATAAGACGTCCTGGTTGGTGTTCTTACGTTTGGCAATAAAAAACATGTTTGAAGAAGATAATTGTTCAATGGT
TGTATCAACATTGTTTATCACTACACCTGGAATGTCTCTTGAGACTTCATTGGAATCAGGTATTGACTTCCATGTCTCAAGGAAGGTAGGGCGT
TCCATTCTTCCATCCTCGGTAAGCAACACAAGTAACGATAATCTATCATTAAAGTACCATACAGGCTGTTGATTGTTCTTCACCGCAATCTGTA
AAAGTGAGTTTGGTGGACCTGGTGCTATATTCTGGAACAAGACCATAGGGAGAAGGGTTCTTGATGATGTTCCTGGTTGAATTTGTGGTACCTG
AAGTGGTCCAGCAGCTGCAAGACCAAATGTATTCTTGTTGAATTGAATCATGAATCCATCCAGTGGGGTATTTGTGTTGTTCTCGAACATTATA
CTGTAAAATATCTGACCATCCCTCCTTACCAGTTGCGCACTAATTTCTAGACCTTGACCAGATGCTGCTGGTAATAGAACTGGCAAAGGGGGCC
CTGCAGCCGCTGCAGGCTGATCAGCCGAGACAATAGCATTATCATCACCACCGTCAAGACCCATAAGATCAAGTAAATCTGGCACGGGAGCAGG
AGCTGGCTGCTTAGCTGCAGCATTATTGGATGAAGAAGGTGGTGGCGATGCACCATTATCAGCAACCAGTGAAGATGATGTTTCAGGATACCCT
CCTTCAATACCATCGGGAAACTCTTCTTCTGTTGTTTGAACAGTTTTCACACGGGTTATGAATGTCTCAGGGGGTTTGTGGTATACAGAGGATA
TGGTAGCAATGTTTGCAAGAAGCTCATCCAGGAGGGATGAATCCAATTGATTCGAATCATCACTGATTACCGGCTTCTCAGCTAAAACGACATC
TTTAGCAGCCTCAGGGTCAGTTGAAAGAAGGCGCCAATATATGTAAGCACGGTCGCGGAGATCTGGATTATCGGTCTCCACAGTGGCGTTATTC
AAAACAACCTGAATCATCTGCTGTGGTCCTTCAGTTGGCTTTTTTAGGAAAAGTTTCACTGTGGCTGTCAATAGCTGCAATTGAACTTGTGCAG
GTTCTTCAGGGAAAGTCTCCAGAAAGCTTTCGAGAAGTTCATCAGCATTATCAATTCTTTCAGCATATTCACCAATTATCCAAATCATAGACGC
CTTGGCCTCAGGCTCGTCCAAAGTGTCCAAACTCTCACATAGCGTGGCAATGATTGATTCATAAGTGTTAGGGTATCTTCTAAAGATATCCTTA
ATGACTATTATAGCTTCTTGAACAACATAATTTACTTTAATCTTGATCAGCTCTAGAAGAACACTAATGCACCGCTCAGCTGCTCTCTCTAACT
TGATAGCACAACGCCCAATAGCGCGAACAGCCTTTCTGACAAAATCTACATCAACTTCTGTAGCATACTCTTTAAACTCCAACAATACCTGGTC
GATATTTCTATCTGAAGCAAGCTTAATCATGATCTCTAGCTTCTCCATTTTCACATAAATTGGATCGTTGTACTTGCAGAAGAACACCTTGATT
TCATGAGCAAGGATTGTAGGACGCCTTTGTACAATAAGGTTGATATTCCTTAATGCAACATATTGTATCTCAGGCTCTGCAGAAAGTAATGTTA
CAAGAGGAGGAGCCATTTTCTTGCATAGGTTCCGAATAACATCAGGACTGGTGATGAGTTCCATTTGTTGAAGGATCATCTTAACAGCTGAAAG
AACAACAGCACAATTTGCATGCTGTAGCCTGGGAGTGACTCTCTCTACAATATTTTCGGCTTCACGCGCATCAGCTGCCTTGTACTTGGAAAGA
GCATCTAATATAAAAACTTGGCCCCACTCGGTACATTCATTCAGAGCTGTAAGGAGCTTTGTAAGTGTATTGCTGGTGATCTCTAAGATGGGTT
TAGTGCTGTTATCTTGAATTTCTGCAAGAGCTGCGACAGCATTTGCTACCACCATAGGGTTATTGTCAGATATTAAATCCTTAAGAGCATCCAG
AAAACCTCTATCTTCAACTAGCTCAGCGTTAATGTCATAAAGTTTGGCGACACATATAGCTGCTGTCTTTCGAACATAAGGATCATCATCCTTA
AGACACCTCTCAAGAGGATCACAAAGATATTCTGTAATTTTATCAACTCGGATGCACCCCATTGTTCGAACAGCTAAAGCTCGGATCAAAGGAT
TTGGGTCCTGTGTATCCTTGACAAATGTATTGACTGCGAGTATTGCCAGATCAGGCTGACTTTTAGCATAATTGATGAGATACAAGTACACAAG
CTTTTTGAGCTCCAAATTTTCCGTCTGCATACAGTTCAGGACATCCGTGAATAGTGACGAAACATCCTTCCCTACAGTCATAGCAGCAATAACC
TTTTTAACCGCATCTTTTCTCTTATCCTTGTATTGTGAATTGAGTTCTTCTTTGAGCTCAGGTATTTCACCTTTTTTTGTTGTTGAGAAGTATT
TTGAATCGTGTCCGCTCATTTTTATTCTGATCTGCCACCGGAGGAGTCAACCACACGGAGGAGGAGGAGGAGGAGATTACAGGGTGGATGTTTC
TTCAAGTGGAGATGTGTTGTCGTTTTGATGTGTGT

Primers for UN94005 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GAATCGTGTCCGCTCATTTT 60.08120CGACAACACATCTCCACTTGA 59.73621114 28232936
2ATTTTGAATCGTGTCCGCTC 60.08120CGACAACACATCTCCACTTGA 59.73621119 28182936
3ATTTTGAATCGTGTCCGCTC 60.08120CAAAACGACAACACATCTCCA 59.621124 28182941