Simple sequence repeat (SSR)
>UN93879 GGTTGATCAAAGTCAAAGTTTTGGTAATGCATAGGTTGGTTAAACACATATTGTGTAGCAGCTAGTTCTATAGGTTGTGCATGGTGGTTACCAT CATCATCATCATCATGGTGGTTGTGTTCAAAGGTGAAGGATTTAAGTCTAGTAAGGATAGAGGGTTGCTTTTGTTTTTGAGTCACTTTTTGTTT ATCATCATCATTATTATTATCTTCTTGTTGTTGTTCTTGTGGTGGTTGGTTGTTGTTAGGTAAGTTGGAAGTGAAAAGAATGGTGGCAATCATG AGGTTAAGAAGGATGAAGAAGACAGTGGAAGTGAACCAGCTGTTGAGTGAAGACCAAAGAGATGGTGATGGTAGAGAAGAAGTTGCAGCTACTT CCATTGTTGTATGATGAGAGAGGTGGAAAGTGTGTGGTGGGAGAGAGTGTTTGTGTGTGTTTTTTGTGTGTGTGTGTGATTGTTTTTTTATAAA ATTTGATGAATTTATTATGAGTGAAGAAGAAGAAGGTGTGTTTGGAAAT |
Primers for UN93879 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TGGTGGCAATCATGAGGTTA | 59.924 | 20 | TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC | 59.661 | 23 | 250 | 269 | 518 |
2 | ATGGTGGCAATCATGAGGTT | 60.203 | 20 | TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC | 59.661 | 23 | 251 | 268 | 518 |
3 | AATGGTGGCAATCATGAGGT | 60.203 | 20 | TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC | 59.661 | 23 | 252 | 267 | 518 |