Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN93879
GGTTGATCAAAGTCAAAGTTTTGGTAATGCATAGGTTGGTTAAACACATATTGTGTAGCAGCTAGTTCTATAGGTTGTGCATGGTGGTTACCAT
CATCATCATCATCATGGTGGTTGTGTTCAAAGGTGAAGGATTTAAGTCTAGTAAGGATAGAGGGTTGCTTTTGTTTTTGAGTCACTTTTTGTTT
ATCATCATCATTATTATTATCTTCTTGTTGTTGTTCTTGTGGTGGTTGGTTGTTGTTAGGTAAGTTGGAAGTGAAAAGAATGGTGGCAATCATG
AGGTTAAGAAGGATGAAGAAGACAGTGGAAGTGAACCAGCTGTTGAGTGAAGACCAAAGAGATGGTGATGGTAGAGAAGAAGTTGCAGCTACTT
CCATTGTTGTATGATGAGAGAGGTGGAAAGTGTGTGGTGGGAGAGAGTGTTTGTGTGTGTTTTTTGTGTGTGTGTGTGATTGTTTTTTTATAAA
ATTTGATGAATTTATTATGAGTGAAGAAGAAGAAGGTGTGTTTGGAAAT

Primers for UN93879 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TGGTGGCAATCATGAGGTTA 59.92420TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC 59.66123250 269518
2ATGGTGGCAATCATGAGGTT 60.20320TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC 59.66123251 268518
3AATGGTGGCAATCATGAGGT 60.20320TTTCCAAACACACCTTCTTCTTC 59.66123252 267518