Simple sequence repeat (SSR)
>UN93345 CCTTAAAACGAAGCCACATCTGGTCTTTCTTTTCTCATGGAACACAGCTCCATGTTGCCCAAGGTTCACTAAACCTAAACTGAAGAATTGATGT GATGGCATGTCCAACCGAATCCTGATCATCAAACTAGTCTGCAGATGTGCTAATCATTGGACGATCTGCTGGTTCAGGTAATGAATTTGGGATA TTCTATTTGATGCTTCGACACCTGGTTCAGTCACCTCTACACCCTCATCATCATCATCAATATGATGATCATCCTACAACATTTGTCCAACACA ACCAATGC |
Primers for UN93345 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | ATTGGACGATCTGCTGGTTC | 60.081 | 20 | GCATTGGTTGTGTTGGACA | 58.908 | 19 | 141 | 150 | 290 |
2 | ATTGGACGATCTGCTGGTTC | 60.081 | 20 | TTGGTTGTGTTGGACAAATG | 57.837 | 20 | 138 | 150 | 287 |
3 | ATTGGACGATCTGCTGGTTC | 60.081 | 20 | CATTGGTTGTGTTGGACAAA | 57.837 | 20 | 140 | 150 | 289 |