Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN92479
TGTTTAAAAAGCTACATAAACCAAAATGGCATAAACATATAAGGTTACTTTGTTATTTCAAGATAAGGTGACACGGTATATGACCAGTCATTGA
ATAACAGTTCAAGTATATAACAATAAAACATACTCGGTCCCCGTGGCGTGGTTGGTAGTCACCCGGGTCGGAAACCTGATAAGCCATTGCTGCA
GTTCCAGACGCTACCGAAATATCCAAAATGACTGCTGTAGAGTACTCTCAAACCTTCGTGCCAAGATTAAAATCTATTTGACCTCTTAACTGAA
GTGAGCCATCTTAAAGTAACCTGTCTGATCTTTTGAATTGAGTGACCCTCTGACTCGTTGCTTTAATTTGACCAATTTAGAGAACCTGATGTGG
TCAACCATATGACATATGTGCGCCGTTCCTGTCTTGTTCAGGTTCGGAGCTTGATTATGTTCATTGACTGCAGCCAAAAGCACTGTGAAGCTGA
AGCTGTACTTTTTGTTCGGCAGTCTTTCTCACGCGAATACATGCTCAGTATAACCGTTATTCCAGCTCTTAAAGCCGGTTGGATTTAAGCTCAA
GTATCTTCAATTCTTTGCTGGTTACCTTTATAATGAAGTAGCACAGTCCTTCTTAGCATGAAATCTTTCGTCTACCCCCAGTTGACCGATAAGT
TTCGTAAATATGTAAGCCTGCATATGTAAATGCATATATTGACCGTCTTTGATGTCATTGTCGTACCCTTTGAGCCAAATTAACAGTGGGATTT
GAAGAAGCATCCAATTCCCAATTAAAGACCAACGCGCCTGTTTCAACTGCTGAGATATTAGATTCGTCGATACCATCACTTGTCATAGTCGTAA
TAGCAGTCAAGATCACGTGAATAAGATCTTCGGCACAGATGATAGCGAATTTTCCAAGTCCCTGTATAACAGTATTGAGTCAGATGAAGCACCA
ACCGGTAAATGACTATCAGCAACAGGAATGCACAGAGAATCCTGAGCACGAACCACGTCCGTCACAAAATCTAGTACCTTTATCGCACCAAGCC
ACGCTGCAGAAATATAGACATTGGATCATAGATGTAACAGACCCCCTTGGCAAATTCATTACCTAAAAGGCATCCTTTATCTCCTTTGATGATC
CAGATCTTGCATATGTTCTATTTGTTCAATCTTCTCCGAAGCATGCACTTTTACAAACAAGTTAGATTGCATCTCTGTATAAGCTCCTGACTTT
GTTGCTTTCGTATTTGCGGCGTTTTCCCGTATACAGCTCATCCTTTTTGTACTCTCCCGGATTCCGAGTTTGCCACCTTTCTTTAGCATCACGG
CTAACCGTATTCAAATAAGTTTTTCAATTAGACTCCAATAAATTCTTTGAAAGCATCAACTGCTCCGCCCGAGGTTGATTATACTCCTGAAGTG
CATCCCACACATAACGTGGTGATATTAGAGCAGAAAGTGATTATTTACGATAGTGGTTGGTAGCCCAGCTTCAGAATCATTTAGGCCTGCTATG
CACATTTCTGCAAGACTCCTTTTTCCGATAGCATATCTCAATGATGTTGGATGCCTCTCCGCGTGCCTGAGTTGCGAATATGTTGTTTAAGTAT
CAGTTTCGTCATCCAAATGTTTGCGAAGGCAGCTGCAACCGCCACCACGTTTTTGGAATATCAACATCATCATCATCATCAATCTTTTCAACTT
TTGGCTCTTCAACCTTAACGCCGTGGTC

Primers for UN92479 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CTGCAAGACTCCTTTTTCCG 59.98620GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620202 15121713
2TGGTAGCCCAGCTTCAGAAT 59.83620GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620246 14681713
3GGCCTGCTATGCACATTTCT 60.24320GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620220 14941713