Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN92477
TGTTTAAAAAGCTACATAAACCAAAATGGCATAAACATATAAGGTTACTTTGTTATTTCAAGATAAGGTGACACGGTATATGACCAGTCATTGA
ATAACAGTTCAAGTATATAACAATAAAACATACTCGGTCCCCGTGGCGTGGTTGGTAGTCACCCGGGTCGGAAACCTGATAAGCCATTGCTGCA
GTTCCAGACGCTACCGAAATATCCAAAATGACTGCTGTAGAGTACTCTCAAACCTTCGTGCCAAGATTAAAATCTATTTGACCTAATACATGTA
ACAAATATTGACCCAACATCTATAAATTTCAACCCAAATTGGCACACCTGAATGCAAATACCGTTTGATCTGTACCTCTTAACTGAAGTGAGCC
ATCTTAAAGTAACCTGTCTGATCTTTTGAATTGAGTGACCCTCTGACTCGTTGCTTTAATTTGACCAATTTAGAGAACCTGATGTGGTCAACCA
TATGACATATGTGCGCCGTTCCTGTCTTGTTCAGGTTCGGAGCTTGATTATGTTCATTGACTGCAGCCAAAAGCACTGTGAAGCTGAAGCTGTA
CTTTTTGTTCGGCAGTCTTTCTCACGCGAATACATGCTCAGTATAACCGTTATTCCAGCTCTTAAAGCCGGTTGGATTTAAGCTCAAGTATCTT
CAATTCTTTGCTGGTTACCTTTATAATGAAGTAGCACAGTCCTTCTTAGCATGAAATCTTTCGTCTACCCCCAGTTGACCGATAAGTTTCGTAA
ATATGTAAGCCTGCATATGTAAATGCATATATTGACCGTCTTTGATGTCATTGTCGTACCCTTTGAGCCAAATTAACAGTGGGATTTGAAGAAG
CATCCAATTCCCAACTAAAGACCGACGCGCCTGTTTCAACATAGTCGTAATAGCAGTCAAGATCACGTGAATAAGATCTTCGGCACAGATGATA
GCGAATTTTCCAAGTCCCTGTATAACAGTATTGAGTCAGATGAAGCACCAACCGGTAAATGACTATCAGCAACAGGAATGCACAGAGAATCCTG
AGCACGAACCACGTCCGTCACAAAATCTAGTACCTTTATCGCACCAAGCCACGCTGCAGAAATATAGACATTGGATCATAGATGTAACAGACCC
CCTTGGCAAATTCATTACCTAAAAGGCATCCTTTATCTCCTTTGATGATCCAGATCTTGCATATGTTCTATTTGTTCAATCTTCTCCGAAGCAT
GCACTTTTACAAACAAGTTAGATTGCATCTCTGTATAAGCTCCTGACTTTGTTGCTTTCGTATTTGCGGCGTTTTCCCGTATACAGCTCATCCT
TTTTGTACTCTCCCGGATTCCGAGTTTGCCACCTTTCTTTAGCATCACGGCTAACCGTATTCAAATAAGTTTTTCAATTAGACTCCAATAAATT
CTTTGAAAGCATCAACTGCTCCGCCCGAGGTTGATTATACTCCTGAAGTGCATCCCACACATAACGTGGTGATATTAGAGCAGAAAGTGATTAT
TTACGATAGTGGTTGGTAGCCCAGCTTCAGAATCATTTAGGCCTGCTATGCACATTTCTGCAAGACTCCTTTTTCCGATAGCATATCTCAATGA
TGTTGGATGCCTCTCCGCGTGCCTGAGTTGCGAATATGTTGTTTAAGTATCAGTTTCGTCATCCAAATGTTTGCGAAGGCAGCTGCAACCGCCA
CCACGTTTTTGGAATATCAACATCATCATCATCATCAATCTTTTCAACTTTTGGCTCTTCAACCTTAACGCCGTGGTC

Primers for UN92477 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CTGCAAGACTCCTTTTTCCG 59.98620GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620202 15621763
2TGGTAGCCCAGCTTCAGAAT 59.83620GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620246 15181763
3GGCCTGCTATGCACATTTCT 60.24320GCGTTAAGGTTGAAGAGCCA 60.38620220 15441763