Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN92329
ATTCTGCACAAACTCTTAAATAGTAACTACTAATAGTGCTCAACCAACATTGTATTCATGGATACATTATACAAACAATATTGCCCATAGCATG
TATAAAAAAATCTATAACAATACTTTGAGAATTTTAATCCTCAAATGACCCGGTAATTTCACTATCCTTTTGGTGAGCGTTTTGTTCTTCGGTT
GCCTTCTGGAGTAGCATGAGGTGATGGAGAACGACGTTGATGTGAAGGTTGTTGGGAGTGTCGATATGGTGATGAATGAGATGAATGGTGTACT
CTTGGTACCTTTGGTCGTTCATTGATGGCATCAAGTTTTTCTAGCTTTTCAACTATTTCTTTCATTGATGGCCGGGTCTTTGGTTCTGGTCCGA
GACACGTACTGGCTAATTGAGCAATTTGGCTTGTAGCTTTGGAAGGGTATCTTCCTTCGAGACGTGAGTCCATTACTTTCTTCAGCTTCCTTCC
GTCAGTTAAGAATGGTTTAATCCATTCAGTTAAATTGTGTTTATCTGCTGGCCGGGTAGTGTCCAGTGCCCGAAGTCCTGTTAGCATTTCAACT
AGTACAACTCCAAAACCGTACACATCGCTCTTCACATACAAGTGTCCTGTAGAAACATACTCGGGAGCAGCATATCCATAAGTTCCCATGACAC
GTGTTGTTACGTGTGATTGACTAGCGGATGGACCAATCTTAGCAAGCCCAAAGTCTGATAATTTTGCATTATATGACCCATCAAGTAATATGTT
GGACGCTTTGAAATCTCTATAGATAATTTGTTTCTCAGAAGCGTGCAAAAATGCCAAGCCCCGAGCTGCTCCTATTGAAATCTTGAGCCGAATA
TCCCACGGAAGTGGCTGAACCGTGGAGCCTCTTCCAAATAGGTGGTTTTCCAAGCTTCCTTTTTGCATAAACTCATATACCAGTAGCAACTCAG
TACCCTCGTAACAGTATCCTAATAATTTCACCAGGTTCGGATGAGAAAGCCTCCCTAGAAAATCCACTTCTGCCTGCCATTCTTCCAATCCTTG
CATGCTCTCAGAGTTCAATTTCTTGACGGCAATTACAGTACTTCTTGAAGTGGATTTGTCTTCGAGCCAACCTTTATAAACCTTACCAAAACCA
CCTTCACCTAATACTGTATCACTTCGAAAATTTCTAGTAGCAGTTTTGAGTTCAGCAAAGCTGAATAACCTAAGATTGGGATGGGGTAAGATGA
GGCCCCCTGGCCCTATAGAGTCACTACCGCTAGCTGCTGAGAACTGGCTGCCAGTGGAGAGTTTGCTGCTTGCTCCTGATGATAACGAGTTTGT
CGTAATGGTAGTCTGTGAAATGGCTGAACTGAGATTGCCAGTGGTGTTAGGGGTTGGATTACTGGAAGAAGAAGAAGAAAAACAAATACCCATT
TTTATTTACAATTTGTAAAACTCAAGTTTTGAATATAGAAAATCAGAAGGCCATCAATCTTCTTCTACTTCTTCTTGAATGGATATCATCAAGT
CTTTTAACCAAGTCTTGGTTTAGATAAATATAGACAGATTCTTGTTCATTTCTTTGACTAGCTAGCTGGACTTTGACTTT

Primers for UN92329 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AACCTAAGATTGGGATGGGG 60.01120GATTGATGGCCTTCTGATTTTC 59.91622275 11951469
2AACCTAAGATTGGGATGGGG 60.01120AGAAGATTGATGGCCTTCTGA 58.87521279 11951473
3TCACTACCGCTAGCTGCTGA 59.91120GATTGATGGCCTTCTGATTTTC 59.91622227 12431469