Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN92038
GTACCTGCAAATAAGGGGAAAATGGTCATCAGTTGTCTTTTGCATCAAGTATTGCATTAAGTTTAGAAGGACAATGGATTGTGTAAAGTGTTTG
ATGTGAACCTGTGTAAATATGTAGTGTAGGGTAAACCAAACATGCAATTTGTAAAGTTGTAATATGATATCAGTATCAAAGATACATGTCTTTG
GACAATATTGATCATAAGTATTCTTGCAAGTCTATTAGTTGGGGGTATCTTGATGAGGAACTGAGGATTGATTAATAGTTTAAAATAATTTTCA
ATCACATACCAAATGTAAAAAATAAATAGTATGCTAACATTTCGTTTACACAGACATGTCGCATTACCTTATGAAACACCCTTCTTTCTTTATA
GTATTATGAGCTGTAATAGCGTGGCGCTTAGTAAGTTTGGTAATGATACAACTGACCAGCTTTTTTGCTTAATGTAACCACAGTTGCTTCAGCA
AGAAAAGCTTTTTCAAAGTCGAAATGGATAAATAGCTGGATAGGTTCCTTTACCTCTTTATTGATAATCGCCACATCTAAATTCTTCATGATTT
TTTCTTTGTATGTCCGACCATTGTCTGCCTTAGGTGAACCTTATCTCCTCCTAACAATAGATATCGAGTCCTAAACCTGTCCTTTTTTGATCGT
CACTGCCAAGCCAAAATCCGAAGTTAAATTTTCCCTGTTCCTGTCAAAAGAATATTCTCAGGCTTTACATCCCTATGTACGACACCCATATCGT
GACAATAGTTAATCGCTGTCATCAATTGCTTAAATATATTAGCAGCCAAATTCCTAATCCATCACTTTCTTGATATCATTCGGCTTCCTACCTT
GAAATACTCTCACATCCATCATATCAGGAACACGTCTGATCAGAATAATCCTAAACTTATCCTCCACATGGCCCAAATTCCTCATCCAGCTCGA
TATCATACCCAAATTCTTCCCCATGTGCATCGTCTAAGTTGTCACCAAATACCTCAAATTAAACTGGTCTGAGTATACCCCTGTGGCTGCCTCT
ATTAGAATCCCTTGGATTAAAAAAAATGACAACTGACTTATTTTTGGACTTCACATCCAAACACCTCCAATCCAATGTGTTGATTAGGAACCGG
AAGAAGAGTATTCTCTTGACCACTTAAAGATGTACACGAACCGATTTCACTCTCGGTAGTTGGCTTGACCGATGGCAAGGCTGGTGTCGTCGAA
CCTGATTGACAGACCATGTTGTTGGTTACCAACTTTGAATAAAACGATTCGCATAGCTCAGGATCCCTATACAATTTCGACTTCTTGTCGCAAC
ATAATCTTGCAACGTTTTTAAAGGAAACAAAGGGAAATGCGTTACTTTAACGGGCAGTTATGGATTTGGCATATTGCTACTGTCTACTAATGGC
AATCATATTTGTGCAGAACTGATAACATCCTGTGGAGAGACTGAATATTATTTACATATGATGATGATGATGATGATTAGATGGAGTCTTTTGT
GTGTGATAGAGAAGATGAATGAGAGATGGAAAATTCTGGAAGATGAGGTGAGGAAGAAGGGGATGTGTGGG

Primers for UN92038 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AACGGGCAGTTATGGATTTG 59.82320ACATCCCCTTCTTCCTCACC 60.31420206 13651570
2GGCAGTTATGGATTTGGCAT 59.79120ACATCCCCTTCTTCCTCACC 60.31420202 13691570
3AACGGGCAGTTATGGATTTG 59.82320CATCCCCTTCTTCCTCACCT 60.44720205 13651569