Simple sequence repeat (SSR)
>UN92038 GTACCTGCAAATAAGGGGAAAATGGTCATCAGTTGTCTTTTGCATCAAGTATTGCATTAAGTTTAGAAGGACAATGGATTGTGTAAAGTGTTTG ATGTGAACCTGTGTAAATATGTAGTGTAGGGTAAACCAAACATGCAATTTGTAAAGTTGTAATATGATATCAGTATCAAAGATACATGTCTTTG GACAATATTGATCATAAGTATTCTTGCAAGTCTATTAGTTGGGGGTATCTTGATGAGGAACTGAGGATTGATTAATAGTTTAAAATAATTTTCA ATCACATACCAAATGTAAAAAATAAATAGTATGCTAACATTTCGTTTACACAGACATGTCGCATTACCTTATGAAACACCCTTCTTTCTTTATA GTATTATGAGCTGTAATAGCGTGGCGCTTAGTAAGTTTGGTAATGATACAACTGACCAGCTTTTTTGCTTAATGTAACCACAGTTGCTTCAGCA AGAAAAGCTTTTTCAAAGTCGAAATGGATAAATAGCTGGATAGGTTCCTTTACCTCTTTATTGATAATCGCCACATCTAAATTCTTCATGATTT TTTCTTTGTATGTCCGACCATTGTCTGCCTTAGGTGAACCTTATCTCCTCCTAACAATAGATATCGAGTCCTAAACCTGTCCTTTTTTGATCGT CACTGCCAAGCCAAAATCCGAAGTTAAATTTTCCCTGTTCCTGTCAAAAGAATATTCTCAGGCTTTACATCCCTATGTACGACACCCATATCGT GACAATAGTTAATCGCTGTCATCAATTGCTTAAATATATTAGCAGCCAAATTCCTAATCCATCACTTTCTTGATATCATTCGGCTTCCTACCTT GAAATACTCTCACATCCATCATATCAGGAACACGTCTGATCAGAATAATCCTAAACTTATCCTCCACATGGCCCAAATTCCTCATCCAGCTCGA TATCATACCCAAATTCTTCCCCATGTGCATCGTCTAAGTTGTCACCAAATACCTCAAATTAAACTGGTCTGAGTATACCCCTGTGGCTGCCTCT ATTAGAATCCCTTGGATTAAAAAAAATGACAACTGACTTATTTTTGGACTTCACATCCAAACACCTCCAATCCAATGTGTTGATTAGGAACCGG AAGAAGAGTATTCTCTTGACCACTTAAAGATGTACACGAACCGATTTCACTCTCGGTAGTTGGCTTGACCGATGGCAAGGCTGGTGTCGTCGAA CCTGATTGACAGACCATGTTGTTGGTTACCAACTTTGAATAAAACGATTCGCATAGCTCAGGATCCCTATACAATTTCGACTTCTTGTCGCAAC ATAATCTTGCAACGTTTTTAAAGGAAACAAAGGGAAATGCGTTACTTTAACGGGCAGTTATGGATTTGGCATATTGCTACTGTCTACTAATGGC AATCATATTTGTGCAGAACTGATAACATCCTGTGGAGAGACTGAATATTATTTACATATGATGATGATGATGATGATTAGATGGAGTCTTTTGT GTGTGATAGAGAAGATGAATGAGAGATGGAAAATTCTGGAAGATGAGGTGAGGAAGAAGGGGATGTGTGGG |
Primers for UN92038 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | AACGGGCAGTTATGGATTTG | 59.823 | 20 | ACATCCCCTTCTTCCTCACC | 60.314 | 20 | 206 | 1365 | 1570 |
2 | GGCAGTTATGGATTTGGCAT | 59.791 | 20 | ACATCCCCTTCTTCCTCACC | 60.314 | 20 | 202 | 1369 | 1570 |
3 | AACGGGCAGTTATGGATTTG | 59.823 | 20 | CATCCCCTTCTTCCTCACCT | 60.447 | 20 | 205 | 1365 | 1569 |