Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN92025
GTACCTGCAAATAAGGGGAAAATGGTCATCAGTTGTCTTTTGCATCAAGTATTGCATTAAGTTTAGAAGGACAATGGATTGTGTAAAGTGTTTG
ATGTGAACCTGTGTAAATATGTAGTGTAGGGTAAACCAAACATGCAATTTGTAAAGTTGTAATATGATATCAGTATCAAAGATACATGTCTTTG
GACAATATTGATCATAAGTATTCTTGCAAGTCTATTAGTTGGGGGTATCTTGATGAGGAACTGAGGATTGATTAATAGTTTAAAATAATTTTCA
ATCACATACCAAATGTAAAAAATAAATAGTATGCTAACATTTCGTTTACACAGACATGTCGCATTACCTTATGAAACACCCTTCTTTCTTTATA
GTATTATGAGCTGTAATAGCGTGGCGCTTAGTAAGTTTGGTAATGATACAACTGACCAGCTTTTTTGCTTAATGTAACCACAGTTGCTTCAGCA
AGAAAAGCTTTTTCAAAGTCGAAATGGATAAATAGCTGGATAGGTTCCTTTACCTCTTTATTGATAATCGCCACATCTAAATTCTTCATGATTT
TTTCTTTGTATGTTGCCATTGCAGATATTGTAGACTGTTCTTCAACAGGTTGTGTACCCCGACCATTGTCTGCCTTAGGTGAACCTTATCTCCT
CCTAACAATAGATATCGAGTCCTAAACCTGTCCTTTTTTGATCGTCACTGCCAAGCCAAAATCCGAAGTTAAATTTTCCCTGTTCCTGTCAAAA
GAATATTCTCAGGCTTTACATCCCTATGTACGACACCCATATCGTGACAATAGTTAATCGCTGTCATCAATTGCTTAAATATATTAGCAGCCAA
ATTCCTAATCCATCACTTTCTTGATATCATTCGGCTTCCTACCTTGAAATACTCTCACATCCATCATATCAGGAACACGTCTGATCAGAATAAT
CCTAAACTTATCCTCCACATGGCCCAAATTCCTCATCCAGCTCGATATCATACCCAAATTCTTCCCCATGTGCATCGTCTAAGTTGTCACCAAA
TACCTCAAATTAAACTGGTCTGAGTATACCCCTGTGGCTGCCTCTATTAGAATCCCTTGGATTAAAAAAAATGACAACTGACTTATTTTTGGAC
TTCACATCCAAACACCTCCAATCCAATGTGTTGATTAGGAACCGGAAGAAGAGTATTCTCTTGACCACTTAAAGATGTACACGAACCGATTTCA
CTCTCGGTAGTTGGCTTGACCGATGGCAAGGCTGGTGTCGTCGAACCTGATTGACAGACCATGTTGTTGGTTACCAACTATGACAACAGCACAT
TGCAAGAAGTTAGTTGAAAAAAGTTAATATAATCTGAACGGTTGTCTATATGTTGTGCCAATAAAGGTTTTTCCTAATACTAATAAATGTCTTA
CTTACATGTACATATACCCTCGTGGGCTATACCTTTGAATAAAACGATTCGCATAGCTCAGGATCCCTATACAATTTCGACTTCTTGTCGCAAC
ATAATCTTGCAACGTTTTTAAAGGAAACAAAGGGAAATGCGTTACTTTAACGGGCAGTTATGGATTTGGCATATTGCTACTGTCTACTAATGGC
AATCATATTTGTGCAGAACTGATAACATCCTGTGGAGAGACTGAATATTATTTACATATGATGATGATGATGATGATTAGATGGAGTCTTTTGT
GTGTGATAGAGAAGATGAATGAGAGATGGAAAATTCTGGAAGATGAGGTGAGGAAGAAGGGGATGTGTGGG

Primers for UN92025 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AACGGGCAGTTATGGATTTG 59.82320ACATCCCCTTCTTCCTCACC 60.31420206 15531758
2GGCAGTTATGGATTTGGCAT 59.79120ACATCCCCTTCTTCCTCACC 60.31420202 15571758
3AACGGGCAGTTATGGATTTG 59.82320CATCCCCTTCTTCCTCACCT 60.44720205 15531757