Simple sequence repeat (SSR)
>UN91042 TTTATAATTCGCTTCTAATTCCTTCCTAACCAAACTATCATCCAATTTTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCTTTCGCCTTCGCACCAAACAGAATA TTCCCCATCCTACTATCCGATTTTTTCGGAACAAAACCTTTTACAACTACACAAGGAGCCTGAATTGGTTTGGAAATAGGCGTAACGAGTTTCG GATACTGCGATAACCTCGAAACCGAGCTCGAAGTCCTACTCGAACGCTTATTAGTTAAATCTACTACAGGTTTTGAGCCAAAATAAGGTGATGA TGATTTGAGCCTCTTTGATAAGTGTGTGTAGTCATTAAACTGTGAATCGAAATCACGTTTGTTGTTGTTGTGATTGTTGTTGTTATTGAGAGTT AAAGTGCCCATTTTTTGTTAATGGAAGGATTTGTGATTGTGATTGAATGTTGGCATGTGAATAAAGGGAGCATTAAAAATTTTGAAATTGAAAT TAGGGTTTTGGGATTTGGGGGAAAATGGTTTTGTGGTGTGTTTGGGTGACCATATCTATTGTTACATCTGATTTG |
Primers for UN91042 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC | 60.101 | 23 | TTCCAAACCAATTCAGGCTC | 60.051 | 20 | 161 | 9 | 169 |
2 | TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC | 60.101 | 23 | TATCCGAAACTCGTTACGCC | 60.096 | 20 | 184 | 9 | 192 |
3 | TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC | 60.101 | 23 | CCAATTCAGGCTCCTTGTGT | 60.111 | 20 | 154 | 9 | 162 |