Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN91042
TTTATAATTCGCTTCTAATTCCTTCCTAACCAAACTATCATCCAATTTTCGACTCTCTCTCTCTTTCGCTTTCGCCTTCGCACCAAACAGAATA
TTCCCCATCCTACTATCCGATTTTTTCGGAACAAAACCTTTTACAACTACACAAGGAGCCTGAATTGGTTTGGAAATAGGCGTAACGAGTTTCG
GATACTGCGATAACCTCGAAACCGAGCTCGAAGTCCTACTCGAACGCTTATTAGTTAAATCTACTACAGGTTTTGAGCCAAAATAAGGTGATGA
TGATTTGAGCCTCTTTGATAAGTGTGTGTAGTCATTAAACTGTGAATCGAAATCACGTTTGTTGTTGTTGTGATTGTTGTTGTTATTGAGAGTT
AAAGTGCCCATTTTTTGTTAATGGAAGGATTTGTGATTGTGATTGAATGTTGGCATGTGAATAAAGGGAGCATTAAAAATTTTGAAATTGAAAT
TAGGGTTTTGGGATTTGGGGGAAAATGGTTTTGTGGTGTGTTTGGGTGACCATATCTATTGTTACATCTGATTTG

Primers for UN91042 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC 60.10123TTCCAAACCAATTCAGGCTC 60.05120161 9169
2TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC 60.10123TATCCGAAACTCGTTACGCC 60.09620184 9192
3TCGCTTCTAATTCCTTCCTAACC 60.10123CCAATTCAGGCTCCTTGTGT 60.11120154 9162