Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN90537
TTTGGAGTCCAGTTGACATGAAAGTGACCTAAACAATGTGGTTAACCAATAATACAAATAACAATAGGGAGCAGAGGGTCCTCCGATTGACATC
TACACCGGCTCCTTAGCAATAAACGTGCATGAAGCAGGTTACTCTATCCCCGGAAACATTAAATAAACACATTTATTTTATTATAAAAATTTCA
TTTTCATTTTCCATATCTACATCCAGTCGCATTAGATGCCTGCCTCGCCAACATATTTATTCCATTTTCACGTTGTTGTATTTAAGTAAGGAAG
AATGCTGTTATTACCAGGTGAGCCAACAATACTAAGCTTAATATTAATCATGCAACAGCTTAAGTCTCCCTTGGTTCAAGCCCAGCAATTTCTC
TAACCACTTGAGCTTTGTCAGCCTCAAACTGTTCGTCCTCTTTATCCGGCTTAAAATCAGCAAAGAGACGGAGAAGCTTGCTCCTATTTGCAAC
AAGTATGCTGACTATGTCAGCTGGCTTATGCTGGTTGGCTGCAAATAACTTAAAAACATGAAATGCTTCTATCTGAATGCTCTTGCTCGATTCT
CTCAGAAGATTCATCAAGATCCTCAAGTTGTCCACTGAGCTTGCATATCGTGTCATCACAGCAGAATTTGAACGGTCTAGCAACATGTCTCCTA
ATAGCTTGATAGCTTGTCTTCTTGTTATGTAATTGGGTGACTCGAGAAGCTTTGAGTTGTATTCTGCAAAGAACCAGTCATAGTTTTTGGAAAG
AAACTCAGCAACAGTTGATTTGTGTCGAGTCAAGAGTTCCTTGAATGTCGCTGCGGCATCAGCAGCAATATCAAAATTAGGGAGTTGAATAAAA
TCAAAGAACTTCTTCATATGCTGCGACTCCAATACATACTTAGCAACACTTTGATGACGTATGCATTCCCTGAGCATCGCACCATAATGTAATG
CCATATCTGGATTTTCATAACCAGAAGCTAAGATATCCATGAGATCGATATTTTTCTCGAGATAGTCGCAGGCGATCAACCGGGAGTGAACCTG
CTGGCGTTGGAGGTTGGCAACGATTTGAGTAGCATCCTTGCGGGCTTCTAGGTTCAATTTGGGGAGGCAAATGATAAAAAGACGAAGAGTGTTT
TCTTTAAAAAACTCTTGAGTGAGTTGAGCACAGGCTTCGGCAACGGGTTCGGCTTCACTGTTGCCGTACAGAATCTGCTTCAGCTCACGGAGGA
CCTTACTCAACGTCGCAAACTTTTCATCGCGTTTGGAATCTTTGGCTGAAGAAGAGGAGGAGGAACTGGAGTCGAGGTAAATGAGGAGATCCCG
AGTTTGGCGGACCAAGTCAACCGGTGTCTTTGGCTTTGACTTGAACAGACCTTTCATTCCCAATCAACCAACACAGCAGAAGAAGAAACAAAGT
GTTTGTGTGGTTGGATAACAGAACAGCAGCAGATTTGTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTATTTGTTTAGAGAGAGAGAGAGTTTGG
TTACTGCTGCTGTTTGTGTGGTTGGATCTATCTATCTAACTTAAGTCTTCTTTTTCACTTC

Primers for UN90537 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AAGTCAACCGGTGTCTTTGG 60.00520ATCCAACCACACAAACAGCA 60.00820202 13301531
2AAGTCAACCGGTGTCTTTGG 60.00520AACCACACAAACAGCAGCAG 59.94620198 13301527
3TTGGCTGAAGAAGAGGAGGA 60.06520ATCCAACCACACAAACAGCA 60.00820268 12641531