Simple sequence repeat (SSR)
| >UN90533 TTTGGAGTCCAGTTGACATGAAAGTGACCTAAACAATGTGGTTAACCAATAATACAAATAACAATAGGGAGCAGAGGGTCCTCCGATTGACATC TACACCGGCTCCTTAGCAATAAACGTGCATGAAGCAGGTTACTCTATCCCCGGAAACATTAAATAAACACATTTATTTTATTATAAAAATTTCA TTTTCATTTTCCATATCTACATCCAGTCGCATTAGATGCCTGCCTCGCCAACATATTTATTCCATTTTCACGTTGTTGTATTTAAGTAAGGAAG AATGCTGTTATTACCAGGTGAGCCAACAATACTAAGCTTAATATTAATCATGCAACAGCTTAAGTCTCCCTTGGTTCAAGCCCAGCAATTTCTC TAACCACTTGAGCTTTGTCAGCCTCAAACTGTTCGTCCTCTTTATCCGGCTTAAAATCAGCAAAGAGACGGAGAAGCTTGCTCCTATTTGCAAC AAGTATGCTGACTATGTCAGCTGGCTTATGCTGGTTGGCTGCAAATAACTTAAAAACATGAAATGCTTCTATCTGAATGCTCTTGCTCGATTCT CTCAGAAGATTCATCAAGATCCTCAAGTTGTCCACTGAGCTTGCATATCGTGTCATCACAGCAGAATTTGAACGGTCTAGCAACATGTCTCCTA ATAGCTTGATAGCTTGTCTTCTTGTTATGTAATTGGGTGACTCGAGAAGCTTTGAGTTGTATTCTGCAAAGAACCAGTCATAGTTTTTGGAAAG AAACTCAGCAACAGTTGATTTGTGTCGAGTCAAGAGTTCCTTGAATGTCGCTGCGGCATCAGCAGCAATATCAAAATTAGGGAGTTGAATAAAA TCAAAGAACTTCTTCATATGCTGCGACTCCAATACATACTTAGCAACACTTTGATGACGTATGCATTCCCTGAGCATCGCACCATAATGTAATG CCATATCTGGATTTTCATAACCAGAAGCTAAGATATCCATGAGATCGATATTTTTCTCGAGATAGTCGCAGGCGATCAACCGGGAGTGAACCTG CTGGCGTTGGAGGTTGGCAACGATTTGAGTAGCATCCTTGCGGGCTTCTAGGTTCAATTTGGGGAGGCAAATGATAAAAAGACGAAGAGTGTTT TCTTTAAAAAACTCTTGAGTGAGTTGAGCACAGGCTTCGGCAACGGGTTCGGCTTCACTGTTGCCGTACAGAATCTGCTTCAGCTCACGGAGGA CCTTACTCAACGTCGCAAACTTTTCATCGCGTTTGGAATCTTTGGCTGAAGAAGAGGAGGAGGAACTGGAGTCGAGGTAAATGAGGAGATCCCG AGTTTGGCGGACCAAGTCAACCGGTGTCTTTGGCTTTGACTTGAACAGACCTTTCATTCCCAATCACACAACACAGCAGAAGAAGAAAGAACAA AGTGTTTGTGTTTGTGTTTTGTGTGGTTAGTTGGATAACAGAACAGCAGCAGATTTGTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTATTTGTT TAGAGAGAGAGAGAGTTTGGTTACTGCTGCTGTTTGTGTGGTTGGATCTATCTATCTAACTTAAGTCTTCTTTTTCACTTC |
Primers for UN90533 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | AAGTCAACCGGTGTCTTTGG | 60.005 | 20 | ATCCAACCACACAAACAGCA | 60.008 | 20 | 222 | 1330 | 1551 |
| 2 | AAGTCAACCGGTGTCTTTGG | 60.005 | 20 | AACCACACAAACAGCAGCAG | 59.946 | 20 | 218 | 1330 | 1547 |
| 3 | CGGTGTCTTTGGCTTTGACT | 60.291 | 20 | AACCACACAAACAGCAGCAG | 59.946 | 20 | 210 | 1338 | 1547 |