Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN90352
CTCGCGTTGCATAGTCTCTGCTAAGGAATTGTAGGAGAAAGCTTAGAATATGAGGACTCGAACAAGACTGATCCTCAATAAGCTTAAAGAGGAT
CCCTTGGTGGAAAAATGAGTAGTGATCATACCAATACTACTTGAGTATGTCCTAGTAACCATTAGCTTTAATTTCTGCTCGTTTTAAACCTCTT
CAAATCTGTGTCGCTCTTCTCCTCCCTTGTGCTTGCAAGTCGCGAACGTGTCAGGTTTTCATCTATGACCGGAGCTTCGTTTTTCTTAAAAATG
GGTGTTGAGGAATCGCGTCTACTGGTATTTGCTCTTTTTCCAAGGTCAATTTGTACAGAGATATTGGCTTCTGATAAGTCCACACCCGAGCTCT
GTAGCGCTTGTGTTAGCGTACTCAATAACCCTTGAGAGTAGATGGTTGATATACTAATTGTGCCACTTTCAATCGTTAGGTCCTGGTCTTTTGA
TTTATCACCAGCAACGGTGCAGTCAGTTGTGCATGATCTGCTTTGCCATAATTGGGATGGTGTGTTTGCTGTATCAGATGGCAGAGTTGAAGGA
GGCGGTGCAGCGACACTCGTGCTTCCACAACCAGGAGAATACACGTTTGGTTGCAAGGGTGATGGGAAAGGAGATGCCAAATTGGTCAAACGAG
GATGTTGACCAATGTCCTTCATGGTTTCGAGGGAACTTAAATCAGAATCTAGTATGTTTTGGTGATCTTTTTTGGGTAGGTTTAAGGCAACACT
GTGCTTGTTCTCGTTCAGTTTTGAAGCATATGGCAATGCTGAGCCAGACACGCCGTTTTGGACTCGTGGTTGATCAATGAACCCTTCTGTTGGT
CTTTGGTTATTGTTCCATGGGGTCATTGCAGGTTGTTCATTAGTCCATCCCCGGCATGATTCCTCGAACTTGTGTACCTTCTCTTGTAGAAACT
GAATGTATTCAATAACCTCTAGTAAAAACGAGGCCTTATCTCTCTTTTGATCACCGTGAGGGATGAGTTCTCTTAACATTGAAAATCTGTCATT
GATTTTGCTTCTTCTACGCTGCTCCGTTGCAGAATGCTTAGATCGCGGGGTGTTGGGCTTTTGATCATGATGTGCTGTGTCAACTTTAACAGAC
AAAACACCTTTGTAGTGTGTGGATGGTTCTTTCTTGATAACAAACTCTTCTACTTCTTCATCCTCGTCTTCTTGCACACTCTTGGCAGACTTTA
ACATATCAACAAAACTCGGATTCTTCTGGGCTGATGATGGACGAGAAGATGATAGAGAACTGATGGTTGCGGTTGGATGGTTATGGGCAGATGA
CGACTGTGATGGGCGCTCCATAGATGTCATCCATGGCATTCCTCCCATCTTCATGCCCCCTTCTCTAATCACATGCCGATTTCCAGCAATATTC
TCCTTCCCTGTCTTTCCCTTCTTGACTGCAGATTCTTCCCAAAGTGAAAAGCCACTTCCGGTGTACGAACTACAATTTGAATTTTCATCGTTTT
TATCACTACCACTAGATTGTGCACCCGTGATCACGACCCCAACCCCTTCAGGCTTTGGCATCCTTTGGCTTTGATTGATTACAGAAATGTGACT
AATACTATATGTCCCTATCCCACCTGGAAGAATATGCTCCACTGTAGTTGGGGGAGCTGGTGGAAGGGACTTTCCGATGGATGATTCTTCGACT
TTATTTGCTTCTTTAGCAACATTTTTCCCGACCCGTTCCAATGGTTGCAAGAAGTCATGAGTTTCGAGGTAGCTACCTGAAGGAGTAGTAGTAG
CAGCAGACGGATCTTGCTGAGCAGGTGAATAAAGTGAAAGAAAATCATGCGTTGGTTTTCTACCTTGAGTACCTAACAAACGTTGTTGAGGATG
CTCCATCTAGATGTACAATTCGATCCGCTATAAATTAGGCTAACTAAATCTTAAAATTCTCGAAACCGAAAATGTCACTGAGATTCAGATCTAG
CAACGTCCATGTAGATGACGTGAATTCGATTGCGCCTCGAATTTTCTGAGGCGCATTCACTGCGTAATTCTTGATCAGAATCTTTATCTTAAAC
CGATCTGAATTTGCGCAATTTCGCGTAATTCAGTAGTTATAAAACCTTTGAAGATAGATTTATAAAACCACACGACATCAACCTTGGATATATA
ACTCTTGTTGTTCCAAAAAATATAATGTGTGTGTGTTTTTGAGGGTGTAAAAAGGGGGTGTTGTGTGTGTGTGATGAAAGATAGGATTGTCAGT
CCAGATCTCCAACTTAACACAAAACACTTTCTCTCTCTGAAACAAG

Primers for UN90352 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GAATTTTCTGAGGCGCATTC 59.79120AAGTTGGAGATCTGGACTGACAA 60.1623259 20132271
2ATTTTCTGAGGCGCATTCAC 60.22120AAGTTGGAGATCTGGACTGACAA 60.1623257 20152271
3GAATTTTCTGAGGCGCATTC 59.79120AGTTGGAGATCTGGACTGACAA 58.79422258 20132270