Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN90347
CGTGTTTTGTGTCGGGTCCACTCGGATCTTCTGATGCTTCTACAAACGACTCTTTTCGAACTGTGCTAGATGTGCTTTCGACCAATGCTTTTCT
GTAGGATCGTTGTAAATGCTAACTCTTTTCTGTAGATGTGCGAACTGTGTTAGATGTGCTTTCGACCAACGATTTGTAGCTACATTTACAAATC
TGAAAAACGCATTCATATGCTTTCAGGAACATCAGTTCATTTACATCCAGTCAAGCATACTACATGTTCAGCTAACCATGGTATCAGCCTTCTC
AACAGCATTATCTCATATATCCGCAACACTATTCTCCGGCGCTTGGGCATTTTGACATCAGATACATGTCATGATTTGAGTTGTGGCCCAAACC
AAGTTCCTTAGCTTAAAGGTGGATGGGTTCTTGTATATTGTTGTAGGCCTGCAACGTGCATCCTTCAGTTTCCTGCGCTTGTGTGCCTTCACAA
TCATTCTTGCATCTCCATGTCCTGAACGCGCATTTTGGCTGCCAAAATTGTTTGACGTTCAAAAAGTTCTGCAACACTACGTGACATTGGTTCA
ACCACTGCACGCAGACCCTGCAATTGGGGCAATGCATTCCCCATATATGACAATTCACATCCCATGAAAGGCACCATAACCATTTTTTTCCTTC
AAAAGCCGCCACTTCCTCTGAGCCTCCAAGTTAATTTGACCATCTTCACTTAGTCCATTCTTGTGCCATTCATAAGGCTCCTCTGCTAGAAACT
TTCCAGCCTGGTTACTTGCTGTTAAGTAATCAGTCTTCAGAATCCACCTTCCAGACGCAGCAACAGCAAAAAAAGGTCTCAGTTCTTTTAATGG
GATCTGGGACAATGAAATGAGTTACCTGGTAAGACCACTGGTGAGAAACTTTGCAAACCCTTCCTTTCAGTCGCCGGATGAGGTGTTGAAACTC
CCTTCTTTGCAACGAATGTCCAGTGAATATAACGAACTCCCAGACGCACTCTTCACAATCCGAACCACTTTTTATAAATTGCTTATTTTGAGTG
CCAATCATCTTAATAATTTTAAGAATGACGCGTGCGCACCCACTGATCTGTGGTAAAATCGAAGTTTATTGACACTCTGAAATACGCCTGACGT
GTGGGTTGATAGAGCTTCATGTAATGGCAAGTGACAAAGAACCAGATGGAGTATATAATAAACGTTACATATGCACAAAAACAAACTTAGTTAA
TTACCAGTAGAATGCCGTGAAGGACAGCAGTGTGCTCTTCGATTGCTGCCTAGGTCAACCATGAAGCTGTTCAGCCAATCCCGTATAGTCGACC
GTAAACAAACGCGCAACAAAGCAGGTTGCTGCCTACCTAGCCATATGACTCGGAATCGTAAAATGTTGCAACCTTCCTTCTTGCTCAGTTATAT
ACCCTTAACAGTCCAGAAGCTTTTTTCTTCCATGATGATAAAAATCAGAAATTGAAATAGGCTAACAACAGCAGATCATGAGGTTTAATTTGAA
GAGTGTATTACTTCATTGCGCCCTCTCTCCAGCCTTAGGTGGTCCACCATAAGGAGTAGCTTTATGAGCACCACGGTTATTATTAAAGCTGCTA
GTACGTTCTGGAGCAGATCAACTGCCACCATGACGTTTGCCGCCTTCACCGCCGGTGGAAATTTTATTGTTTTTGATGAGGACTTCAAGTGACA
TGTCTAAAGATGCACCGGCCATTGTGATTAGTGGAATAAGGGTTTGTTCGGTTAGTGGATGAAGGCGGTGGAACTCGAAGAAGATCTGGAAACT
GATGTCGGTCAAGAGGTAATGACTAAAGAAAGGAACAGGTGAGAACTGAGAAGTGTGTGTGTGTGGTGGATTCTAGAGAATAACTGAAGGGGGT
GAAAATATGGACTCGGGCTTTGGATAATAAAGAATAAAACGGGCCA

Primers for UN90347 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTCGGTTAGTGGATGAAGGC 60.07420ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620170 17391908
2TGGAAACTGATGTCGGTCAA 60.08820ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620130 17791908
3ATGTCTAAAGATGCACCGGC 60.10320ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620217 16921908