Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN90346
CGTGTTTTGTGTCGGGTCCACTCGGATCTTCTGATGCTTCTACAAACGACTCTTTTCGAACTGTGCTAGATGTGCTTTCGACCAATGCTTTTCT
GTAGGATCGTTGTAAATGCTAACTCTTTTCTGTAGATGTGCGAACTGTGTTAGATGTGCTTTCGACCAACGATTTGTAGCTACATTTACAAATC
TGAAAAACGCATTCATATGCTTTCAGGAACATCAGTTCATTTACATCCAGTCAAGCATACTACATGTTCAGCTAACCATGGTATCAGCCTTCTC
AACAGCATTATCTCATATATCCGCAACACTATTCTCCGGCGCTTGGGCATTTTGACATCAGATACATGTCATGATTTGAGTTGTGGCCCAAACC
AAGTTCCTTAGCTTAAAGGTGGATGGGTTCTTGTATATTGTTGTAGGCCTGCAACGTGCATCCTTCAGTTTCCTGCGCTTGTGTGCCTTCACAA
TCATTCTTGCATCTCCATGTCCTGAACGCGCATTTTGGCTGCCAAAATTGTTTGACGTTCAAAAAGTTCTGCAACACTACGTGACATTGGTTCA
ACCACTGCACGCAGACCCTGCAATTGGGGCAATGCATTCCCCATATATGACAATTCACATCCCATGAAAGGCACCATAACCATTTTTTTCCTTC
AAAAGCCGCCACTTCCTCTGAGCCTCCAAGTTAATTTGACCATCTTCACTTAGTCCATTCTTGTGCCATTCATAAGGCTCCTCTGCTAGAAACT
TTCCAGCCTGGTTACTTGCTGTTAAGTAATCAGTCTTCAGAATCCACCTGCGTTTGTCAATTAAATTCTAAAACTTAATATTTTGAGCTATTAT
ATATCCTAATTTTCAAGTTAGCGGTGTCATTAAACGTCTAAATAACAGTTCACAAAAGAAAAATGTATAACACAAATGTAGTTTAAATGTGAGG
TTTTAATTTTATAGTACCTTCCAGACGCAGCAACAGCAAAAAAAGGTCTCAGTTCTTTTAATGGGATCTGGGACAATGAAATGAGTTACCTGGT
AAGACCACTGGTGAGAAACTTTGCAAACCCTTCCTTTCAGTCGCCGGATGAGGTGTTGAAACTCCCTTCTTTGCAACGAATGTCCAGTGAATAT
AACGAACTCCCAGACGCACTCTTCACAATCCGAACCACTTTTTATAAATTGCTTATTTTGAGTGCCAATCATCTTAATAATTTTAAGAATGACG
CGTGCGCACCCACTGATCTGTGGTAAAATCGAAGTTTATTGACACTCTGAAATACGCCTGACGTGTGGGTTGATAGAGCTTCATGTAATGGCAA
GTGACAAAGAACCAGTAGAATGCCGTGAAGGACAGCAGTGTGCTCTTCGATTGCTGCCTAGGTCAACCATGAAGCTGTTCAGCCAATCCCGTAT
AGTCGACCGTAAACAAACGCGCAACAAAGCAGGTTGCTGCCTACCTAGCCATATGACTCGGAATCGTAAAATGTTGCAACCTTCCTTCTTGCTC
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AATTTGAAGAGTGTATTACTTCATTGCGCCCTCTCTCCAGCCTTAGGTGGTCCACCATAAGGAGTAGCTTTATGAGCACCACGGTTATTATTAA
GCAGATCAACTGCCACCATGACGTTTGCCGCCTTCACCGCCGGTGGAAATTTTATTGTTTTTGATGAGGACTTCAAGTGACATGTCTAAAGATG
CACCGGCCATTGTGATTAGTGGAATAAGGGTTTGTTCGGTTAGTGGATGAAGGCGGTGGAACTCGAAGAAGATCTGGAAACTGATGTCGGTCAA
GAGGTAATGACTAAAGAAAGGAACAGGTGAGAACTGAGAAGTGTGTGTGTGTGGTGGATTCTAGAGAATAACTGAAGGGGGTGAAAATATGGAC
TCGGGCTTTGGATAATAAAGAATAAAACGGGCCA

Primers for UN90346 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTCGGTTAGTGGATGAAGGC 60.07420ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620170 18211990
2TGGAAACTGATGTCGGTCAA 60.08820ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620130 18611990
3ATGTCTAAAGATGCACCGGC 60.10320ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620217 17741990