Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN90345
CGTGTTTTGTGTCGGGTCCACTCGGATCTTCTGATGCTTCTACAAACGACTCTTTTCGAACTGTGCTAGATGTGCTTTCGACCAATGCTTTTCT
GTAGGATCGTTGTAAATGCTAACTCTTTTCTGTAGATGTGCGAACTGTGTTAGATGTGCTTTCGACCAACGATTTGTAGCTACATTTACAAATC
TGAAAAACGCATTCATATGCTTTCAGGAACATCAGTTCATTTACATCCAGTCAAGCATACTACATGTTCAGCTAACCATGGTATCAGCCTTCTC
AACAGCATTATCTCATATATCCGCAACACTATTCTCCGGCGCTTGGGCATTTTGACATCAGATACATGTCATGATTTGAGTTGTGGCCCAAACC
AAGTTCCTTAGCTTAAAGGTGGATGGGTTCTTGTATATTGTTGTAGGCCTGCAACGTGCATCCTTCAGTTTCCTGCGCTTGTGTGCCTTCACAA
TCATTCTTGCATCTCCATGTCCTGAACGCGCATTTTGGCTGCCAAAATTGTTTGACGTTCAAAAAGTTCTGCAACACTACGTGACATTGGTTCA
ACCACTGCACGCAGACCCTGCAATTGGGGCAATGCATTCCCCATATATGACAATTCACATCCCATGAAAGGCACCATAACCATTTTTTTCCTTC
AAAAGCCGCCACTTCCTCTGAGCCTCCAAGTTAATTTGACCATCTTCACTTAGTCCATTCTTGTGCCATTCATAAGGCTCCTCTGCTAGAAACT
TTCCAGCCTGGTTACTTGCTGTTAAGTAATCAGTCTTCAGAATCCACCTGCGTTTGTCAATTAAATTCTAAAACTTAATATTTTGAGCTATTAT
ATATCCTAATTTTCAAGTTAGCGGTGTCATTAAACGTCTAAATAACAGTTCACAAAAGAAAAATGTATAACACAAATGTAGTTTAAATGTGAGG
TTTTAATTTTATAGTACCTTCCAGACGCAGCAACAGCAAAAAAAGGTCTCAGTTCTTTTAATGGGATCTGGGACAATGAAATGAGTTACCTGGT
AAGACCACTGGTGAGAAACTTTGCAAACCCTTCCTTTCAGTCGCCGGATGAGGTGTTGAAACTCCCTTCTTTGCAACGAATGTCCAGTGAATAT
AACGAACTCCCAGACGCACTCTTCACAATCCGAACCACTTTTTATAAATTGCTTATTTTGAGTGCCAATCATCTTAATAATTTTAAGAATGACG
CGTGCGCACCCACTGATCTGTGGTAAAATCGAAGTTTATTGACACTCTGAAATACGCCTGACGTGTGGGTTGATAGAGCTTCATGTAATGGCAA
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AAGTGACATGTCTAAAGATGCACCGGCCATTGTGATTAGTGGAATAAGGGTTTGTTCGGTTAGTGGATGAAGGCGGTGGAACTCGAAGAAGATC
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AAGGGGGTGAAAATATGGACTCGGGCTTTGGATAATAAAGAATAAAACGGGCCA

Primers for UN90345 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTCGGTTAGTGGATGAAGGC 60.07420ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620170 18412010
2TGGAAACTGATGTCGGTCAA 60.08820ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620130 18812010
3ATGTCTAAAGATGCACCGGC 60.10320ATTATCCAAAGCCCGAGTCC 60.28620217 17942010