Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN89182
TGCAAAGAAGGGCTGCCCGATTTGCATTTAAAAACTCTCATATGCAATGTGTCATTCACATCATTTACTTTTAATCTATGTAGCCCAAAACAAA
AACCACAAACAAAGGGTGGCCATTTAACATCCTAAACCTATAAACTTTCAGTTTTTTAAGTTAGGGTCTATAGAAGAAAACGCCAAATCCAGAG
CAACATACACTGCCTGACGTACAAGTCACTATAACATTGTTGGTCTGTATTTGGTGCAAAACCTCAAGTTAAACCATGTCAACCGAACTATTCA
CCACTGGTTGTGCAGGTTGGCCACCGGTAATAGCAGGAGTAACACGCGGCTGAATAGAGGGTTGTACAAGATTTCCAATCATTTGCTTATTTGA
CTTGTGTTTTTCCTCCCCCTGTGCTGAAGTTAACTTTTGGGATCGAGGTTGACCCGCATCCAAAGCAGCCTCGGGCTTCCTTTTTACCTTTTTC
TTCACCAAAGCTTCGGAAACCGTTGAGTTACTCTTATTGCTGGAACTGCCCTTTAGTTTCTCTTGTTTTGGCCTGTCTGCGGCAAGTGCCTTTA
CAGAATTGGACTGCCCTGCGGCAGCATTAGCAGCCATTGTGTTGGATATTGATCTCATGGGTGAACTCGAATCAGTGACTAGCTTATCAGGAAT
GCGTTGGGCCAGACCCACAGAGCCAACATCAACAGTAACAGTCTCAGCTTTGATGGCAGATACCTTTTTCTTCTTCAAGTTCTCCTGGTCCTTG
TGAACATTTAAAGCTTTTCTCCTTGATATTGCCCTACTAATTGCTCGTTTGATCCCATTGTTATCCATGCAGCCTTTTGGCCACATTCCTGCTA
GCTCTGCATAAAGCTTCCTAAGCTGGGGGTTTGCATCTTCATCGAGCCCCTCAATGAAAAGATCATAAAGCTCACAAATCTTGTCTTCTAAAGC
ATCATCTGTGGTAAATCTGCTTTTAAGAGCTTTTTCTTTGGTACTAGTCTCCTGAAAATCATCAGATGATCCAGGCGGCTGCTCAATAGGCGCT
GGCTTCATCATGGGAGCCCGTATCTTAACCATCTCATCTACTTCCTTCTTTAACTGCTGCACCTTTGCATCTTTCTCTTCTTTAGCAGACATTC
CAAAAACAACCATAGTTTGAAGATTTCTCTTCAACGATCTGAGCTGTATCAGATGACCAACGATGCCCATCAAACGATTAAGTAGCTCCTTTGA
CAGTTTCCCATGAACAGTGTGCCCTAGTCTTGCAACTTTAGCCAGCTTTTGCTTTATTTCGGGAGGCATTCTTCTTTTAACAGCCTGGTTATCA
GCTTCAGGAATCTCCATACGCGGTGGCCTTGTTTCCGCAACTGTCTTCTCCAAATCCTTGATAGCTTTTTCAAGCATCATGCTTGCGCTTTTAG
GTTTAGCGCTTGAACCTTCCTTTCTCACCATATGAGCGGTCTTCGGTTGCTGGGGAGTCTCAAAAGCCTTGGTATCTGCCTGTGGAAGAATTAA
GCTTTTGTCCTTTGATTGGTTCAACTCCTCTGGGTGTTTAGACAACTGTCGGGATTTTGACACATCAGCACCCTTGTCAGCGGTCATCTGACTC
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TTGCTGCCACTTTAGCTTCACCATTCAGGACCCTTGTTGGAGATTGATTTTTTGTAATTTTAGAATCAGCTTTCTTCACAACAGTTCCGAGGGC
TATTACTGTACTCTGGTATTTCAGATCATCTTGGTTAACAGTTGGTTTAGTTATACTACGGGGCGGAGTGATGAGGTTCTTGTCTGCTGATGCA
ACAACTTTCTTTGCTTCCTTCTTACTAACTTTCATCTGTTTATTTGGCAATTGCCCATCATTGCTTCCACCATCACCTTTTGATGAATCCTTTC
TTCTCCTCTTTTTTGGTTGCTCAGTTGGCAAAGCTGGAGGCTCATTCGCGCGCTCTAACTTCCCGCGGTTGACAAAGAATCCATCATGTTTTAT
TGCTGAGTTATCAACCTGGAAATAATCATCCAAATCAGCGTCGTCTATAAAGGAGTCGTCTGTGTCATACTCATCATCGTCAGGAACATCATTC
AGATCTTCCTCATCACTGCTATTTTTACCCATGTACAGGCGTTCAATCTTCTCAATGACGGCGTTAAAACGGCTACCATTTGGTACATCATTCC
CTTCATTTTTTTCAGCAGACTCTCCAATAAGAGGCGCAATGCGAGACTCAAGCGCAGGTTTAGCAACAACAGGTGCATCACCAACAGCTTCTTT
ATTATTTGTATTATTATTCACATCATCAGTTTTATTATTATTATTAGCAGAATCAGAAGCAGCAGCAGCTTTATTAGCGTCTTTCATAAGCTTC
TTCCATGACACAATCGTCGTTTCACCAGGTATTAACTCCACCTCAAACCTCTGCCGTCCACCTCCGCACAGCACCGTCGTCGGCGCCGTCGCAC
CTCCACCGTCATCCGCCATTGATTAATTCCGGTGAGTGATTATTACTGTGTGTGCATTTAATTGTGAGCCCTAGAGAAAAATTTGTGTTTAATT
TGATTGATGAGGCAGGCAGGCAGGC

Primers for UN89182 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ACTCTCCAATAAGAGGCGCA 59.97820ACGACGATTGTGTCATGGAA 59.96720190 22752464
2ACTCTCCAATAAGAGGCGCA 59.97820AACGACGATTGTGTCATGGA 59.96720191 22752465
3AACAACAGGTGCATCACCAA 60.00820CGACGATTGTGTCATGGAAG 60.11220143 23212463