Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN89016
TTAGAAATGTAGGGTGGTAATTGGTGTGGTTTGGCTTCCGGTGGTGGTATGGCATGATAGTGGTTGTTTCAATGGTGGCAGTGATGGATATAAA
AAAGAGATGATAGTGTTTATGTGTTTTTGTTTATGAGGGAAGTAGATGAGGTATGAGAAATGAGAGAGAGAGATATGGTGTGGAAGGGTTATGT
GTTTTATTATTTTCTGCGTGTGCGTGTGTGTGTATGTGTAAGGAACACGCACAAATTCATCCTTAGACGATGTATCTTCTTTGCTATGCAAGAC
CCCGCCCACAAAAAGCTTCATTTCTAGATTTTTCCCATCTT

Primers for UN89016 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GGTAATTGGTGTGGTTTGGC 60.09620ACACGCACACGCAGAAAATA 60.32420200 16215
2AATTGGTGTGGTTTGGCTTC 59.83620ACACGCACACGCAGAAAATA 60.32420197 19215
3GGTAATTGGTGTGGTTTGGC 60.09620CATACACACACACGCACACG 60.73120209 16224