Simple sequence repeat (SSR)
>UN87890 AACACCGGCGACGGCGGCGGAACGGTGGTTTGCGGTGGTGATTGGAATTTGGTGATGTTATTAGCGGATTGGAAGCGTTTATTGAAGCGTAAAT GGGTTTCGATATCTTGTTGAGTTTGTTGCTTTTGGATGTGTTTTTGGGCGTTGGCGTTGTTCCATCTTGAGAAGTGGGGGATGATGGTGGTGGT GGTGGTTGGACGGTGGAGTGGTGGTTGGTGGGTGAAGATTGGGAATTGGATTGTGGGTTTGAATGTTAGTGACATTTTTGGAGCTTGGGTTGAG CTTGAAGCTCAATCT |
Primers for UN87890 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | TTCCATCTTGAGAAGTGGGG | 60.042 | 20 | CTCAACCCAAGCTCCAAAAA | 60.22 | 20 | 129 | 154 | 282 |
2 | TTATTAGCGGATTGGAAGCG | 60.185 | 20 | CTCAACCCAAGCTCCAAAAA | 60.22 | 20 | 225 | 58 | 282 |
3 | TTATTAGCGGATTGGAAGCG | 60.185 | 20 | TCCAATTCCCAATCTTCACC | 59.727 | 20 | 181 | 58 | 238 |