Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN86472
TAGTTTTAATGTGTTTTGGGATACATCAATAAGGATATCTATACAGGATGATACATAATTCATATGAGATACATTATGCAACAAGTGAACAGGT
ACTAAAGGTCATCTGCGACTGCAAAATGGTGACGAACAAGGTTCGTGAATACCACAATCGCGGGTTATTTTCAAGAAACACATCTGGAATAATG
GTAAAAATGACTGGCCATCGTCAAATTTCACTACCGAGACGTAATTTCAAGAAATACTTTTACGTTACATGGTTTCAAATTTGGAAATGTTCTG
AAGACATAGACATTACATAACCCCTAAGACACGGGATGTCGGGATCTAATTAAAAACATCCCTTATATGTTCTTATACCGCTGCTGCAAGCTGG
TTCCTATTCCACACGAGAGGCTGAAACTCCTCCTCGATCGTTTCTTCTATCTTCTCCCATGGCATCTTGTGCTTTGCTAGTTGTCGTTTCTTTG
CTGGCACTCCGAACGTCTTTGCAGAATTCTTATAGCAGTATCCAGCTTTAACGTCACAAATGGGATAATCACCAGGACAACAAGCGGCACTATT
CTTGCAACAAACAGCATCGGCGTAACCACAACAACCATGGATCAAACACAAGTTATAGAACTCAAATATGCAACAACATGTCTGGTCAGCCGCA
CAATATGAGAAGTCACCACACTTGCTAGGTGCAGGTGGCGGTGGGGGTGGTGGTGGATGTGGTGGAGAAGGTGGGGCTGGTGGTGGTGGTGGAC
CAGGGGGTGTAGGCGCCGCAGTAATAGGGTACACCGGCTCAAGGTACATTCCACAAACCCCGTTTTTAATATTAGTGTTTCTCTCCATTAGAAT
GTACCCTTCCAGTCCCCAGTATGTGCCCCATGAATTCTTGACGATCCAATAGTCCTTACCATCTTGTGAACCATAACCAACGATTAGCACTGCG
TGGTCTATACTATATGGAGTGCTTGTGCATTGTCCGTTATATACACCCCCAGTGTATAGTTGAAAATCATAAGCCGAACCCATAATACCAATAG
TAACAGGGGTACTTGCCACAGCACAGAAAACTGCATCTTCATTTGATTCTACTTCCACATAGCTATCGAGCGAGACAACTGTCTTTGATTTCTT
TGTTTTGTCGCATTTACCATCGCGGCCATTAGTACTGATGTATGGATAATCGGCTTCAGAATCAATTCCACCATTCTTAATAATCCATCTATAA
GCAGTGTCCATGTTTCCACCATCGCACCCATAATCATACGTGTCACAGTCGACAAGCTCTTGCTCGGATAGTCTAATGAGGTCACCGGTGGCTA
ACGCATTAGCACTTTCGATGGATCCAGTCACTGAGAATGCCCAACAACTTCCACACTGGCCTTGGTCCTTAATTGGTGTAACTACTCCTTTGTC
TCTCCAATCCAAAGAAGTTGGTGCATCACAAGTCCTCGAACTTACAGTCATGTTCCTTGTTACACCCCCCATCTTTAACTTATTACTTCTAGGC
CCCTTAACTTTTGACATATACATCTCTTTAAACTCTTCATTACTCAAGTCAGCAAACTTATTCAACCCCACAGTATGATCTAGCTCTGACTTCC
TCTGTGAGTTTTTCTCCAATACAAACTTTATACTTTTCTTAAAGTTCTCAAGCCTAAGCTTCTCCTCTTCTTCATGTTGGTATGTTTTGCCATG
CAACTCTTTCCATTTTCCAAATAACTCACTAACTTTCTCACTTGATAAAATATCATTTTCTTGACCCTCAAGTATAGAAAACTCACTAGGAAGG
GTTGTGGATATAGAGTATGATGATGATAATGATGAAACATAGGTTAAGAAAATGAAAAGTGTGAGAATGGGGTTTGAGGTAGCCATTTTAATTG
GA

Primers for UN86472 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTCAGCCGCACAATATGAGA 59.8320GGGGACTGGAAGGGTACATT 60.05220215 649863
2GGACAACAAGCGGCACTATT 60.1420AACGGGGTTTGTGGAATGTA 60.08820272 545816
3GTGGATGTGGTGGAGAAGGT 59.81720GGGGACTGGAAGGGTACATT 60.05220153 711863