Simple sequence repeat (SSR)
| >UN86133 GTGGAAATATATATGATATACTATTAAACTTAACTGTTGTATAAACACATAAATTACATGAGCTCGTGTACAATGAATTTATGCAATAGCAAGT TTGTAACTTTAACTAGTTCGAATGGTCTAAATTTTATTTGACAACAAATGCACTCGATGAGCCAGTAAAATGACTAATCGACCCAAATAAATTC TTGGATGCGCCAAAATGGGTCACTCTGTAAACCCCAGATGCAGTCGATTGTGGGATTCGCCACTCTATAGTAGCATGACTCTGAGCACTCAGTT TTGATGGCCTTGACCACTTGAAACGAAGGCAAATATCATCATCATCAAAGGCTGGAACCCACGTATCTTGCCCTTGAAGCAACTCTACCAGAGC GAAAGTGCCTTCAGTCATGAGATCGTTTCTAGGACACGCTGACCAGAATACAACAGTCACTGTGTCACCTTTCTTGAAAGTGGAATCCTTTGCG ATGTCGGTTTTAACATCCCCGAATTTGACTCCTAGTGGGGTGGAGTCCACTACCACACCCGGTAGCAAGCTTATCTGCTTGTCTAGTAGATCTG GTGGTTGTGGGCCTGCTTCAACAGGTTTTCCAGTGACAATGGCTGTTGCGAGCTTTGTGAACTCCTGAATGTAGGCACTGAGAGTATGTGGACC ATATAGAGTCGAAGCTCCCTCGTATCTTTGCATCTCGTACTCCTCATAGGTGGTAATATACTGAGAATAGGTATTAGTTAGACCAGCTATCACA ACATGAACTTTTTCTTTAAAAACAGCACTAACAGCATCACGAAGACGTCTCCCAGCCATAGTTGTGAATTCTCCAGGTACACTGAGAATCACCA TCTGCCCTATCTTTAGCATTTGAACCGGTAGAATTGATGGCGCCCAGTCATATGGTTGCTTCATTTCCCCAGTATCGAGAAGGATAGGTTTTGG CTGTTGACAGTCTTTTTGCTCCTTACTTGGGGTTTTGAGCACGTTTCGCACCAACTTCCAAAATGGATTCCCAGTGTTGTCTCCTTGCTTAAAA TCAAAAGCCCCCGGTCCATCAGTAGTACCAGCTGCAAATCCAAATCCCATGGCAGCAGGACATGTTTTAACAGTTTCACTCCCTCCTCCTTGTT TAGGAAGTGTTACCTCAAGCTGTGTAAAATCCAGATAACTGTGACGAAAATCGATCTTTCCATTCAACTTTTCAGAAGCAGTATTAAAAAGGTC AGCAGCTTTTTTGAACTGTCTCTCTCCAATAATACGAGTGCTTTCAAATTCATCTGGGTAGCCTGGTCCTCGGCCATAACATAACTCATTCTTC CCACCACAAGTACTATGATTGAAGTCACAAGGTAGTCCAGTATCTGTGCAGAATGCCCCAAGAATATTTGGACTCACGTCCCCACAATTTGATT GGCAAAATGCAGATACAAAGCGAGGCCGATCTGCAGACCTAAGAGAACTTCTGACCCGTCTTGCTACGCTCAAGTATTTGGTTACTGGTTTACC TGAAGTGGACTTGAAAGAAGCCGCAAGTTCCAGCAATTCATGATGGTTTCCTTGGGGACCCTGAACAATGTTAGAGACTCTGCGTGGGTTCACA TTAACAATTCTTCCAGCAGTTTTCTGATCAAACCAATCTTCCATAAGGCGAGCAGCAGTTCCTTTATTGTCCCCACTAATCAACTCATTCGTGC GACTCATTGAAGTTCCATGAGTAGCAAACCAGTTAAAGCTACCCACTGGACCCCATTGATCATCTACAAACTTCAGAAGGGTCATTTCTTTATC TACATCATACTTGTATTTTGCGCGTTCTGCTGAAGGATTATTGAGATAAGCGCTAGGACTGCGATTAACTCCTGCATCTAAGATTTCTCCTTTG TTTACGTATACTGATCCTGAATGAAGGTTATCGTGAGCAAGAATGATGCTTTGCTCAATACCATCAACTAATGCATCAAACGACTGGCGAACAA ATCCCAGAGACGTAACAATATACACCACATACTGCAGATAGCCCCCAGGGCCTGCATGGGTATGTATACCACTAATGGCAACATTCTTCTCTGT ATATAAATTTCCATACCTTGCCTTTAACCTCTCAAGGACTTTGAGTGTTACAAGTTGCGAACCCATGCAAGCATCGAGATTTACAAACACCACA CGGTTTCCTTGCGGCTCAGCCACAATAAATGCACGAGATCTCAACCGAAAGTGAATGCCAGATGCGGTTTGATCCGAGTTGGCATATCCCATCA TGTTGACATCAGCTGCAGGCCCAGTGATGTCATAGCTTCCTAGCCCAACTAAGTAATTAGAAGCAGATATCGCTTTTTCCGCATTGTGTGCAAA AACTAGTAATAACACCCAAAACCATGCAATTGCACGTTGTCGCTGTATGACAGCCTGAAAGAACTCCATCACGATTCCACCACCAGTCTTAAGG TATTTTCTTCACACTGAAAATGCAACAGAACAAAAATTCTATATCTCCATTAAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGCATTAGTA TGCAGATGTAAGATAACATAAGTATAAAAGGTCGGAGCAGCTGATAAGTAATAAACGTTATCAAACATGTTATTTAACATGCATTAGAAATAAG CAGGTAACTGATCTCGTGCCATTGTGCGTGTGTGGCTGGTATTCCCCTGTGAGCTGAAAAAGGTAACGCATGTTTGTCTGAGTGAACCTATAGT TGATGATTGTGTGCAATAATTAGGACCGTGCGACCTATTAGCTACATTTTGCGGTGGTCTATTTACATCCAAAGGATGGGCTACGCAAATACAC AAAAACGTAAGTTAATTAACTAATTGTAAAAGGCAGGAGCAGAGAGTAGTTACCAACTGTCACCGTAAGGCATTTTCTAAATTATGTTACAAAT AAGTAGTTAAACAACTTGATTGAGTTGCACGCATGTGGTTGATGTTGCCATTTGATGTGGAACAAAGCACTTCTGGTTGTTCTTTGATACCTTA TAAAGACACACGCCTGCGTTTAGTCTTCTGAAATGAAGTCAAATAAGTGGCGTATACTTGTTTGCTTATACCTATAATGGTAATAATTACCATT AAGTTAATATGAAGCACCTGAAAACCTGTAACTGCTGCTTGTGTATAATCACCACGATCCCACAGTGTATGTTGCAATTTATGCACTGACCTAT TCAAACCCGCCGAAGTCCTTAAAAGGTTGTCATCACCGGTAGCAGTCTTAAAGTTGTAGAGGAGATATTCAAAATTGGAAGCTATAGAGGAGAT ATTCAAAACCCGTATAGTGTAACACAATTAAACCCAAACACATTCCATTTAAAAAAAATGAATATTAAAAAGTTAAAACTAAAATTAATTGCAC ATCTTACATGCCATTTGAAGGTTAACCCCTGGTCTTTTATTCTTCCTGTCCGTATCCGTCTCGACACACAACCGGTGAATATTAAGCATAGCCT TAGCTTCCCTCTCTTCCTACAACAACTCCTCACTCGCATACTCACTCAAAAACTCCCTCTTCTTCTTCTCCAAAACCATCTTCTCGATCTCCTT CTCATCCGGCAACGACACATGAACAACAAACTCCTTCTCTTTTTCCTCCTCCAAATTAGCACTTCAAGACTGTGGTTTTGCGTTTCAGTTAATT GATAGGTTTTTCAGTATTGTGGAATTGTGGAAGATGATGTATGTGGATTTGTGGATGACCTGAAACCGTATATCAATGATTGGTGAACCGTCAA TTTCATGTAACGTAGGCTT |
Primers for UN86133 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | CGCTGTATGACAGCCTGAAA | 60.011 | 20 | TTATCAGCTGCTCCGACCTT | 59.978 | 20 | 195 | 2391 | 2585 |
| 2 | CGCTGTATGACAGCCTGAAA | 60.011 | 20 | TATCAGCTGCTCCGACCTTT | 59.978 | 20 | 194 | 2391 | 2584 |
| 3 | ATATCGCTTTTTCCGCATTG | 60.061 | 20 | TATCAGCTGCTCCGACCTTT | 59.978 | 20 | 262 | 2323 | 2584 |