Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN85453
GACCCTTAAACGATAGGAGCCTCTTGATGCCCTTTCGCATACTGTTGAGTTCCCACACTCTTTTTGTTTGCAGCTGGTCCAATCCTCATTGGTC
TGGTTGAGCATAATCTTCCATTCATTTCAGTCATGGCACGTATTTGCTCACTCTCATCTCCAAATTTCACAAAACCATAACCTTTTGTGCGTCC
TGTAAGCCTATCAGTTACAACCTTAGCACCCTTAACAGAGGTATAATGAGCGCTAAATGTCTCCTGCAATGTATAGTCTGTAACATCAGCTGCC
AAATCCCCAACAAATACAGTGTAGTCAGGTGTATCGTCTTGTTTCTTTTCACCGCCACCAAATGAAGCCCAGTTGAGCCTGAAGACCTGCTCAA
CATTAGGCATTAAAGTACTATTGTATGCCTGTAAATGCCTCTCTGCAGCAGCATGGTTAACAAATTCAATAAAACCATAGCCCTCAGATTGCCC
AGTTTGCTTGTTACGGATAACTTTCGCAGAAACCACCTCTCCAGTTTGAGCAAAACATGTAAGAAGATATTGCTCATCCATCCAATACTGCAGA
TCTCCTATCCACAGTGTACGGATCTCATCTGCAGATGCTGGCTGAGGTGGTGCTTGTTGGGTGTTGTTGTTGTAAGTGTATTGGACTGGTGGTG
CTTGTTGGTTCATCCATTGTTGTTGTTGTTGGTATTGTGGATCCATTGATTGAGAATTTGGGGATTTTGTGAGCCCTAATTTGTGATGATTT

Primers for UN85453 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GATTGCCCAGTTTGCTTGTT 60.11820GGCTCACAAAATCCCCAAAT 61.05320271 463733
2GATTGCCCAGTTTGCTTGTT 60.11820TAGGGCTCACAAAATCCCC 59.87919274 463736
3GATTGCCCAGTTTGCTTGTT 60.11820TTAGGGCTCACAAAATCCCC 61.17320275 463737