Simple sequence repeat (SSR)
>UN85453 GACCCTTAAACGATAGGAGCCTCTTGATGCCCTTTCGCATACTGTTGAGTTCCCACACTCTTTTTGTTTGCAGCTGGTCCAATCCTCATTGGTC TGGTTGAGCATAATCTTCCATTCATTTCAGTCATGGCACGTATTTGCTCACTCTCATCTCCAAATTTCACAAAACCATAACCTTTTGTGCGTCC TGTAAGCCTATCAGTTACAACCTTAGCACCCTTAACAGAGGTATAATGAGCGCTAAATGTCTCCTGCAATGTATAGTCTGTAACATCAGCTGCC AAATCCCCAACAAATACAGTGTAGTCAGGTGTATCGTCTTGTTTCTTTTCACCGCCACCAAATGAAGCCCAGTTGAGCCTGAAGACCTGCTCAA CATTAGGCATTAAAGTACTATTGTATGCCTGTAAATGCCTCTCTGCAGCAGCATGGTTAACAAATTCAATAAAACCATAGCCCTCAGATTGCCC AGTTTGCTTGTTACGGATAACTTTCGCAGAAACCACCTCTCCAGTTTGAGCAAAACATGTAAGAAGATATTGCTCATCCATCCAATACTGCAGA TCTCCTATCCACAGTGTACGGATCTCATCTGCAGATGCTGGCTGAGGTGGTGCTTGTTGGGTGTTGTTGTTGTAAGTGTATTGGACTGGTGGTG CTTGTTGGTTCATCCATTGTTGTTGTTGTTGGTATTGTGGATCCATTGATTGAGAATTTGGGGATTTTGTGAGCCCTAATTTGTGATGATTT |
Primers for UN85453 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GATTGCCCAGTTTGCTTGTT | 60.118 | 20 | GGCTCACAAAATCCCCAAAT | 61.053 | 20 | 271 | 463 | 733 |
2 | GATTGCCCAGTTTGCTTGTT | 60.118 | 20 | TAGGGCTCACAAAATCCCC | 59.879 | 19 | 274 | 463 | 736 |
3 | GATTGCCCAGTTTGCTTGTT | 60.118 | 20 | TTAGGGCTCACAAAATCCCC | 61.173 | 20 | 275 | 463 | 737 |