Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN85323
CTGAGTTTCTGACTCGACATTACGAGCCGACTAATACTCCGTAATCACAAAAGTATTAATTTTCTTTCCGTTGAATTCGAACCGCTGACCTCCA
CTTTAAAAGGCCGATATTCTTAGATAACCGGTTAACCCGGTTTTAAAAACCCGAGTTTTTTTACCCCTTTTTGTGGCCAGCACCGGTCCGACCG
GTTGAACCAGCCGAGTCAAACATCGCTTCAAAACACTACTTTCTTAGTAAACAAAGTCCTCAAATTAAACATACTAGTACTATTTCCACCACCA
CCTTCACCGGCCGGAGTTACACCGGCGGCGACACTTCCGGCAACTCCAACACCACTCCGGCAACTCATACCTTTAGGAACAACCTTAACACCAC
CACGTGTGGGACCCACACTATTTCTCAAAAGATTATCATGTAAACTCCTACTTTGTCCAAATCTTTTGGCCCCTTGCCAAACCGGACTAGACCG
GCCCAAATGAACCCCGGCTCGACCGGGACTACTCGGCCACTTCCGGTTCTTGTCTCCGGTTGAGTTGCTTCTTGAACACGGTGCACTGCTTACT
TTCCGGTTCCCAACCACAGCTGTTCTCGGTCTACTTCCACTAGTCCCAGCCGACCTGCTCCGAGAAAAAGGCCATAAGTTTATATTCAGCTCCG
CCGTGCCGGAAGTTCCCGGACCGGTTCCGGCGCCGGAAAATTTCTCCTTGGTTTTTTTCTTCTTTTCTTTGTCTTTTTGATCTGGGTTTTTCTT
GAAAATGTCTTTCCATCTCTTGGAAGCTGTTAAAGGTGTAGCTTTTAGGTCCGATCCGGTGATATTCTCATCTGGGTCATTTGGGTTTATGGGT
TGGGTGTTTTTGGGTTCAAAGGTGTCATCTTTATGATGTTTTTGATCTGGGTTTTGTGTGTTTGTGGGTTCTTGATGATCTTTTTCATCTGGGT
ATGTGTGATGATGGTGGTGGAGGGGGAGGAGGATGCCGCCGGAGAAGAGCTGGTCGGCGGTGGACTGGTGGAGCTGGGGTTGGGTTGTCCAGAA
TTCGAATTCGGGTGAGTTTGAGGCACTGCTTCTTCTACTGTTACTGTTGATGATGGGACTTTCCATTGAGTTGATGAGTTGAGAGAGTTGTGTG
TGTGTG
AAAGAGATGTTGAGTTGTGTTTATTGATATTACAGGGGACATGGA

Primers for UN85323 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ATGTGTGATGATGGTGGTGG 60.09620TCCATGTCCCCTGTAATATCAA 59.15822239 9411179
2GTGTGATGATGGTGGTGGAG 59.80120TCCATGTCCCCTGTAATATCAA 59.15822237 9431179
3GGTGAGTTTGAGGCACTGCT 60.45320TCCATGTCCCCTGTAATATCAA 59.15822135 10451179