Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN04964
GGGAGTTTTACTGTTAATTAATAATATAAATCAATATTGGTGATTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAAAGTTTCTAATTTCTGCTTTTATAATAA
TAATAATAATAATAATTGCAACATTACAAATATAGCAGTAACAGGAATGTTTGGATTATTGAGTATTGATTGAGTACATAAATTGAACAGCACT
CCACAGTATCCATCACCTCAAATAACTCTCATTAATTTCCATTTCAACATCAAGACCAGTGTATTTACACAAATGCCTAGCGTATGGGAATCTT
CAGCTCTAAAAACAGGACCAACCACAAATACACGTTGAAAATCACCAGAGATTGCCATTTGCTTGTGAAGCTGAGGCGACTGTGCTAAACATGC
TGGCTGATTTTTGTACTCAAAATTGAAAATAGCTGCTCCACCTTCGCTAGTGCCTGCAATTATCATTGGAGTGTCGATTTCGCAAAAACCTTTA
CTCAGCAACAACTGCCCAAATAAATTTTTCACTTGGCCTTAAAGCGAAAAACCGCTTCCCTTGCTGGTGCTCGCATAGCCAAAACTATATTGTC
CAAGAGTGTGTCCTCCAAATTCTCAAATTCAACTTCACTTCTAGACGCATCCTCATAAGTAATATGACGCTTAGTAGCAGATCTGCTTATGCAA
TGAATCTTCCTCACAAGTACTTCAACCTGTCATTGATTGAAGCTCTTTGACAGGAATGTCACCATAGTTGGCAGCACTTAGGATCATGTTCTGC
CATTGATTGAAGCTCTTTGACACCAAAACAGTTGTGTGTCATTCAAAAGAAACTTCTGCTTATTTGCTGCTTCCCATATGCGAGAGACCAATGC
AACAGGAAACCAACAAAATGGAGCTCAAGCCGATGGGTTGGCTAATCAGAATATTTCAGTTCACCCATCACTATTAGCGCCACCGTCTTCACCC
ACATCTTTTACCAACTATGCACTTCAATCTACGGCCCAATCACTCTGTTTTCTATCAGCAAACTCACCTGGTGGTCCATCTAACATAATGTTTG
CCGCTCGGCCATACGCCCACGAAACCAACCTTGTATCTCCACCTGTATTCTCAACCTTCACCACCGAGCCATGAATGTCCCCAAACATTAAAAT
GATTATGATCGATGCTTATGAAATCCTGCAACTTGAACTCCCGACAATCACAATCAGCAATGTGGTGGTGCACTCTTATATCATGAACAGTCTC
CTTGCTCCTTGGTTTGAGCCCCCATCATGCTCCATATCACTTCTTTCTCAGCCCACCTCCAACCTAAGGTCCATCCGGGAGGCGAGACATGGCG
GTATTGATGGAAATTATACATTGTAACGACTGCAACGTAGCCATCAGGGGTCCAACTAATGATATCCCACTTGATTGTGATGTTTCCATTTGGG
TCAAGTGCATCATACGCTTCTGTGGAAGTAAAACTGAATGAAGAAAGCAATATAGCAACAACAATGGTGGAAAGTGACAATCTTGTTAAAGATC
TGAAGCAGTAATCCATGATTACTTGCTTCAAAGGTTTCCAAGATCCGACAGTGTGTTTTAAGTGTGTGTGTGTGTTTTTAGTGTGTGTGTGAGA
GAAATATTGAGAGATGTGGGAGTGAGTGTCTTT

Primers for UN04964 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCATCATACGCTTCTGTGGA 59.8320CACTCACTCCCACATCTCTCA 58.81821210 14171626
2GCATCATACGCTTCTGTGGA 59.8320ACACTCACTCCCACATCTCTCA 59.75622211 14171627
3TGATGTTTCCATTTGGGTCA 59.7520CACTCACTCCCACATCTCTCA 58.81821233 13941626