Simple sequence repeat (SSR)
>UN84594 TGATGATCTAACGAACCCTAGCACAGCAGTTGGGTTTTCATTTGGTTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTAAAGGGGGTGGTATGCACCTCAACTCG TCTGATTTATGGAATGAGGACTGATGATACTTTTCATGCCCAAGTTGCCACTAATACTCAACTTCTTGAGGTAGTCTCGCTCTTCCTGCATACA CGTACTGCATTTCCTCCGTCCATGTCTGGTGACGGAAAGCAATCCTCATTCGTGGTACATTTGTCTTCTGTATATCATTTCCTTCAGGTCCACG CTTGTAATACTTGCTTCCAAGCCAATGTGCCTTGGCTGCATGTAAAAATCCAGACTGGTAAACAGAGTTTCTTGCTATCTCACAAAGATCACAC GAACTTAGCTTCCAAACCTTGGCTGCTACACCATATTCTTCCACCAAGGGTTCTTTTGTTAGATGAATCTGCAACGGGTCATCAGTTGAAAGTG AAACATTTAACCCACGCTGGAAAAACATGGGAAATGGGTTGCGATGATAGTCTAGAAAGAGGGAATTGTTGCTCAGTGGAGACATAGCCAATCC GATCTGAGCAAGGTAGTACAAATACTGTAATACAGGAGATTTCCTCAAATTTATCCCATGTGAAATATTATGGCACAAAAGGAAGCCAGCTGCT AAATGGTCAGTATCACCCGCCTCTCCACAATGAGGCCTCAACCTAATTGTTGGCAGTCCTTTAGATTCTCGGAGCTTATTAAGGGTATAAAGGT TTGCATAGCAGTAATATGCATAATAAGCATATGCAGGATTGAAGTCATTTGTCCATTCAGCTGGTGTAGGCATATGCTTTGTGGGACGCCTTTC AGGTTTGCTTTCATCGTCCACAAGGTCAAGCCCAACAACCTGCATTAGGAATATGTGGAGTTGTGGATGAGATTTCGGATCAACCGTGACTTCA AAAAGTGGAATAAACACATTGTCCAAAATATTCTGAAAGGATGTCACGGTTCCCATGCTCTTGTATATGTTATATAGCCGTGGAAGTTGAATAA GCCAGACAGCATTTTCACTGTAAATTTGATTGTTGATAAACCAACTCGCCAACTGATCCCATTCACTTTGCTTCCTCCCATATATGGACACCCT ATACTCTGCCACCTGGTATTTACTTGCATCAAGATCTGATAGAACTTGTTTTGTCAATTCTCCCAGAAAACGACCTTGAATCAAGTTGTCTTGC TTTAGAAAGATTTCTCTGAGCCTACTCTGTCCACAAGGATTGTACTTGAGATTGAATTTGTCAAACCGGTGAAATGTACTCTTGTCCGCATGAA CATCCAACAAGTCAACATTTAGGTCATACCCGGTTAAGTCCAAACTCTCGAAAACTTCTTTCAGTGTAAGATATTGTCCATCACGAAATATCAC AACCTCATCTGGTTCTTTCCTTAATTTTGATTTAATGAAGCGCAAAAGGTGCTTTTGGTTCATGCAAGCGGAATGATGGACATGGGTGTCAACT TTTCTGATATTGTAGAAATCACGATGGGGTGCACCTTTTTGAGCTAAAAACTCACTATCTGAATTCACTAACAGATGAAGACGGAATTTCTCCT CAAGAAATCTCAGTCGATGATAACAAGCAGAACGGACATTTCCAACAGCGATTATTTTGAGAAGATGATGCATGTCTGTGAAAAAAGTTGTTGC ACTTGCGACAGGGAATAGATCAACGGTATCATTTTCACTTGCGTAAACATGTACAACTCCATCTTCCATCCTGAAGTGGTGTTTAGTTGTTTCA ACTGGTATGAATCTAAATGGATCATTTTTAAACTCGGATAAAGCAGAGTCTCCTGCATTTGGTTGTGTCCATGGATTATGATTTTCCCTGAACA CATATTTTTCACGCAAGTCCAAGCATTCACGTATCATTTTCCGCACTTCTTCCTCTTCATGATTTAATGATTCTTTCATCATATTTGTTTGTGG GATATTTAAGTTGGGATCATTGACCGCGATGTTATCTGGAGAAGGTTCTACCTTGCCGTTGCCATGATCTACAGTTGAAGCAGTTTCTTTTGAA ACGTTATTATTGTTGGTATTCTCAGCTTGTGGCAGAAGCAATGAAATATTCTGAATGCTCGAGTATATATCATGTGCAGAAGTGTTAACGCTCT CATCAAAGTATTGATAGTCCTCCCCAACAGCAGTCTCGGTTCCATCATCGTCAGAATTGTCAGCACCATCATATGCATAACTAGCTGGTGATCT TGGTGTATGGATTCTGCCATAAGAGCCTACCCTGGGCTTGGAACTAGACTGATGATCATGGTGATGTTCACCTTGTCTATGATTCATTTTAAGA GGCGGTAAATTATCGGAAACAAGCTTCTCCATAGACCCAATCCATTCACTACTCCCTAACCTTACATTCGGTAACGAACTCGATATCCCGTAAC CATTATTACTAATATTACTACTATTATTCCCCACATAACCATCAAAACCATCATCATCTTCCTCCTCTATATAATCAATATCGTCATCATCATT TTCACCATCAATACCATCTTCTAAATAACCATCGTCATGGGTTGTCGTACGACGTCGTATTTTGATTAAACGATCGATGACTTGATCGACTGTT CGTTTGTGAATATAGAAAGCTGATATTGCCATTACTGACGCTCCGAATAGCGTTGCTAGTGCGAAATGGATTGGTGTTATCGATGAATCCATTT TTTGGTTGAGACAGGTGTTTGTGTT |
Primers for UN84594 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | AGCACAGCAGTTGGGTTTTC | 60.299 | 20 | AGACATGGACGGAGGAAATG | 59.927 | 20 | 196 | 20 | 215 |
2 | AGCACAGCAGTTGGGTTTTC | 60.299 | 20 | CAGACATGGACGGAGGAAAT | 59.927 | 20 | 197 | 20 | 216 |
3 | AGCACAGCAGTTGGGTTTTC | 60.299 | 20 | CCACGAATGAGGATTGCTTT | 60.074 | 20 | 224 | 20 | 243 |