Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN84594
TGATGATCTAACGAACCCTAGCACAGCAGTTGGGTTTTCATTTGGTTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTAAAGGGGGTGGTATGCACCTCAACTCG
TCTGATTTATGGAATGAGGACTGATGATACTTTTCATGCCCAAGTTGCCACTAATACTCAACTTCTTGAGGTAGTCTCGCTCTTCCTGCATACA
CGTACTGCATTTCCTCCGTCCATGTCTGGTGACGGAAAGCAATCCTCATTCGTGGTACATTTGTCTTCTGTATATCATTTCCTTCAGGTCCACG
CTTGTAATACTTGCTTCCAAGCCAATGTGCCTTGGCTGCATGTAAAAATCCAGACTGGTAAACAGAGTTTCTTGCTATCTCACAAAGATCACAC
GAACTTAGCTTCCAAACCTTGGCTGCTACACCATATTCTTCCACCAAGGGTTCTTTTGTTAGATGAATCTGCAACGGGTCATCAGTTGAAAGTG
AAACATTTAACCCACGCTGGAAAAACATGGGAAATGGGTTGCGATGATAGTCTAGAAAGAGGGAATTGTTGCTCAGTGGAGACATAGCCAATCC
GATCTGAGCAAGGTAGTACAAATACTGTAATACAGGAGATTTCCTCAAATTTATCCCATGTGAAATATTATGGCACAAAAGGAAGCCAGCTGCT
AAATGGTCAGTATCACCCGCCTCTCCACAATGAGGCCTCAACCTAATTGTTGGCAGTCCTTTAGATTCTCGGAGCTTATTAAGGGTATAAAGGT
TTGCATAGCAGTAATATGCATAATAAGCATATGCAGGATTGAAGTCATTTGTCCATTCAGCTGGTGTAGGCATATGCTTTGTGGGACGCCTTTC
AGGTTTGCTTTCATCGTCCACAAGGTCAAGCCCAACAACCTGCATTAGGAATATGTGGAGTTGTGGATGAGATTTCGGATCAACCGTGACTTCA
AAAAGTGGAATAAACACATTGTCCAAAATATTCTGAAAGGATGTCACGGTTCCCATGCTCTTGTATATGTTATATAGCCGTGGAAGTTGAATAA
GCCAGACAGCATTTTCACTGTAAATTTGATTGTTGATAAACCAACTCGCCAACTGATCCCATTCACTTTGCTTCCTCCCATATATGGACACCCT
ATACTCTGCCACCTGGTATTTACTTGCATCAAGATCTGATAGAACTTGTTTTGTCAATTCTCCCAGAAAACGACCTTGAATCAAGTTGTCTTGC
TTTAGAAAGATTTCTCTGAGCCTACTCTGTCCACAAGGATTGTACTTGAGATTGAATTTGTCAAACCGGTGAAATGTACTCTTGTCCGCATGAA
CATCCAACAAGTCAACATTTAGGTCATACCCGGTTAAGTCCAAACTCTCGAAAACTTCTTTCAGTGTAAGATATTGTCCATCACGAAATATCAC
AACCTCATCTGGTTCTTTCCTTAATTTTGATTTAATGAAGCGCAAAAGGTGCTTTTGGTTCATGCAAGCGGAATGATGGACATGGGTGTCAACT
TTTCTGATATTGTAGAAATCACGATGGGGTGCACCTTTTTGAGCTAAAAACTCACTATCTGAATTCACTAACAGATGAAGACGGAATTTCTCCT
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GATATTTAAGTTGGGATCATTGACCGCGATGTTATCTGGAGAAGGTTCTACCTTGCCGTTGCCATGATCTACAGTTGAAGCAGTTTCTTTTGAA
ACGTTATTATTGTTGGTATTCTCAGCTTGTGGCAGAAGCAATGAAATATTCTGAATGCTCGAGTATATATCATGTGCAGAAGTGTTAACGCTCT
CATCAAAGTATTGATAGTCCTCCCCAACAGCAGTCTCGGTTCCATCATCGTCAGAATTGTCAGCACCATCATATGCATAACTAGCTGGTGATCT
TGGTGTATGGATTCTGCCATAAGAGCCTACCCTGGGCTTGGAACTAGACTGATGATCATGGTGATGTTCACCTTGTCTATGATTCATTTTAAGA
GGCGGTAAATTATCGGAAACAAGCTTCTCCATAGACCCAATCCATTCACTACTCCCTAACCTTACATTCGGTAACGAACTCGATATCCCGTAAC
CATTATTACTAATATTACTACTATTATTCCCCACATAACCATCAAAACCATCATCATCTTCCTCCTCTATATAATCAATATCGTCATCATCATT
TTCACCATCAATACCATCTTCTAAATAACCATCGTCATGGGTTGTCGTACGACGTCGTATTTTGATTAAACGATCGATGACTTGATCGACTGTT
CGTTTGTGAATATAGAAAGCTGATATTGCCATTACTGACGCTCCGAATAGCGTTGCTAGTGCGAAATGGATTGGTGTTATCGATGAATCCATTT
TTTGGTTGAGACAGGTGTTTGTGTT

Primers for UN84594 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AGCACAGCAGTTGGGTTTTC 60.29920AGACATGGACGGAGGAAATG 59.92720196 20215
2AGCACAGCAGTTGGGTTTTC 60.29920CAGACATGGACGGAGGAAAT 59.92720197 20216
3AGCACAGCAGTTGGGTTTTC 60.29920CCACGAATGAGGATTGCTTT 60.07420224 20243