Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN83626
AAAAAAAAGTACACTTATATAAATTATAGATAAAGAAAAAGAATTGTGACCTTGAGATGAGGTCATAAAACAGTTCTAATGATACATCCAATAA
CTAAATTTTCAGGCAGTGCTTATATAGCACCACAAGAATAATTTGCACAAACCAAAATGAATTCAATTATGCTAAAGTGGAAACTCATGTCTAA
ACTCAACCTTCAGTGTTGACGCCTTCCGAATTAAAGAGGACGTGTGTGGCGGCCTGCAGCCTTTCCACATAACCGTGCATTCTTTGGGATTGGG
AACTCGTCTCTGATGGACCCTGAGTTTGTGTAAACACGAAGGTAAAATTGTTCACCTAGGTATTGTCTGGCCCAGTATTCTGTTCTCACGTTCC
ACATTCCAACGTTATCAAGTGCAACGTAAATGGCTGACCATGATTTTGGGTAAACCTGAATGGTGCTTCGTGCAACCCCATCTCGAAGGTTGTA
ACCGTTCCTGCTAGCTTGAGTCCATTGTCCTCCATCCATTCCGACAACAAAGAACTGATAGCCATCAAGGTGATAGCTAAGCACAATATCTGAA
GGATTTTCAAAGACTATTTCAACAAACGATCTAAAATCAGCCCCCATAACTGATGTATCTTGATAAAGGCCGCCACCTGTTGGTCTATCGGATA
TGCTTCCAACACGGAAAACACCACCAATGTTGAAATAATCGGCAAGTTTAAGAGGAGTGTCAGCTGGGACGAAGGACACACTGTTGATACCGTA
TCGTTGTTTGCCATTAACTTGACCGGCAGTACTTTGGAGAATGATGGTTCTGCTTGTGTTTATCATGCCGTAGTGGTATGAACCTTGTGGGTTT
GGTCTTGGTCCGCTAGCTGTAAGATTGGTCCTGATGGAACGGGCCTGGTTAAGGGACCAATCGACTTGAATGGTGGGCCCACCAGGGATTGGGC
CAGAAACTTTGCCCGCGGAGTTGGCATAATGAAGGACACCTGTTGTTGTAAGGATTGGAGTAGTGAACCGGGAGGACACAACAATGTAGTAGTC
CTGGCCGGGTTGATCAGCTGTAAATAGTACTGAATATGATTGACCAACATGAACATCTAGAGATGAATATGTTTGTTGGACCGTATGTGTTCCC
TCCACTTCGACTAATTTCATCTTGTGGTTTTGAATACGGAAGTTTAGGGAATTTTGTAGTCCCACGTTTGATATTCTAAGCCTGTATGTTTTTC
CTTGTTCAACATTGAAATATGCACCACCTGGTCCACGTCCATTGATGAGTATTCCAGCAGGGAAAGGTATTCTATGACCTCCGTCTAGAACTCT
TCTCAATATAGTGTGGTTAGCTTTGTACCAATCTCCGATGAGCACGGTGTAGTCGCCTGCGGGTTCATCAAATGGGACAGGGATTCTAGGACGG
CTTAGAATCCTAATACCTCCGAACCCGCCAGCAGCTTTGTGGAACGATAAAGATGGGAAATAGTAAAAGCTTCCGATTTGATCCTTGACTTGAA
GGATGTATGTGAAGTTTTTACCCGGTGGAATTGGACATGTTGTGCCGTAAACACCGTCTTCAAATGAATTCCTTCTTTGTTGAATTCCGTTCCA
GGAGATCAAAAATGGCTCAGGTAAACTGTTGAACACGTTGATAATAAGATTATCATTTGTAACAGAATGAAGATCAGGTCCTGGAAATTGTCCA
TTAATCAATATACCCTGTTGACGAACTCCAAGTGGATAAATATCACCCAAAGTAACATTCCAGTTGAAGAACTTGTAGGGATCTTCAGCTCCGG
TGATAGCAACTAGAAGTGCACCGACAGCGAAGCAAACGGCGACTTTGAGTTGCTGCATTATTATTATTATTAACTGTGGCCGGTGAAATAATGA
AAAAAGTTTTGTGGAGAATGGGTTGGATATAAAGTGTTGT

Primers for UN83626 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CAGCTCCGGTGATAGCAACT 60.41920ATCCAACCCATTCTCCACAA 60.17320131 17781908
2TCTTCAGCTCCGGTGATAGC 60.50420ATCCAACCCATTCTCCACAA 60.17320135 17741908
3ACCCTGTTGACGAACTCCAA 60.54520ATCCAACCCATTCTCCACAA 60.17320205 17041908