Simple sequence repeat (SSR)
>UN82220 GTGTTTTATTAATTTTGTGTACAGCTATAACAAACTGGCGCTAAGCTACCTGTTTATGAAATCAAAAAAGTTCACACTTGCAAATAAAGAACAG TAACAGATGGGTCATAACCTTGACAAAGAATCCTCCTATCCCATCTTGATATTGTTGTTTAGATTATTGAGATGATTGTTTGAATCATTGATCC TTTAATGAGGGGGAAACTTGTGTTAAGTCACTCTTGCTTTTACCTTTCTTCATTTTTGCTTTAAACTGAGACTTCAGTACAAGAGTCTGCACTG TGTTTGCAAAATTCCCGACAGCCATAATTATCAGAAGGATCCCACACGTAATTACCTGCCATTCAGAAATAACACCCGCCACTGCAGTTTGTAG CAATAGCACACCCACGTATGCTTCAAAAGCCTGCAAGACGAAGAGTATGGGCAATAACAACCATAGTTGACCTTTAACTCCAGCAGTTTCACCC CACACAACGTCCATTCTTCTAGCCTTTCCTAGTGCAATGCGTGTATAGAGTCTCTGCCGTTGGTATCGATTTTGGAGAAGCATTGCTACTCCTT GCATGATTGCCCATCTCAAAAATAATTGTATACCTTTCTGCTTCTGGGCACAGTCAGGTTGCCTTTCTATTTCCCAAGTGAGGCTGATAAGTGC CATAGCCATAGCACAATAATGATGGTATATCCACCATGGACGTATATCGCTTCCATTAACTCTCAAAATATTTTCTCTTAAAGCTAACCCAGTG TAGAGAAAGAGCAACCACGCCTGGTAAAGCTGGACAGGTAATGCAGGGAAACATCCATCCCAAAGCCACGATCTTAACCCCAGTAGCAGTGATG GAAAAATCAGAAACAGATATGCAGTTCTATCTCTGAAACTATAGTATTCCTCCTTCACTTTCAATTGAACATCCTTTCTGTTAGCACGGACATT TATTGGACCAAGAAACATTCTCAAAAACCTTCCATGTGATTTACAAGGAAGAAAAGTAGCAGCATCTCCTTCACTTAATGTATAACTTGCTCTA CTTAAATCTTCACCCAATTTATCTGCATGTTTAGAATCCAAAGCCCCTTTTTTAACTTCAGAAGCAATAAAAGACTTGATAATCTTGATATTAG AATCAAGAGCTAAAGCTCGTTGTCTTAAAGAAGCTTCTTCAATTGAATTTTTAGATATTAAATTCGACGCTGATTCTTGTAACTCTTTACTTTC TTCTATTATTCTATTCACTTCTGAACACACGTCCCTATCACTATCACTACCACCCGTTGTTGTTGTTGTTGGTGGTGTTGTTGAATCGCCCATC GGTAATAGATTTGATTATTTATATGTGTGTGTTTTTTGGTGTTTTTTCCGGCAGGCGG |
Primers for UN82220 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | AGAATCCAAAGCCCCTTTTT | 59.068 | 20 | TCTATTACCGATGGGCGATT | 59.392 | 20 | 259 | 1067 | 1325 |
2 | AGAATCCAAAGCCCCTTTTT | 59.068 | 20 | AATCTATTACCGATGGGCGA | 59.392 | 20 | 261 | 1067 | 1327 |
3 | AGAATCCAAAGCCCCTTTTT | 59.068 | 20 | CTATTACCGATGGGCGATTC | 59.392 | 20 | 258 | 1067 | 1324 |