Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN82220
GTGTTTTATTAATTTTGTGTACAGCTATAACAAACTGGCGCTAAGCTACCTGTTTATGAAATCAAAAAAGTTCACACTTGCAAATAAAGAACAG
TAACAGATGGGTCATAACCTTGACAAAGAATCCTCCTATCCCATCTTGATATTGTTGTTTAGATTATTGAGATGATTGTTTGAATCATTGATCC
TTTAATGAGGGGGAAACTTGTGTTAAGTCACTCTTGCTTTTACCTTTCTTCATTTTTGCTTTAAACTGAGACTTCAGTACAAGAGTCTGCACTG
TGTTTGCAAAATTCCCGACAGCCATAATTATCAGAAGGATCCCACACGTAATTACCTGCCATTCAGAAATAACACCCGCCACTGCAGTTTGTAG
CAATAGCACACCCACGTATGCTTCAAAAGCCTGCAAGACGAAGAGTATGGGCAATAACAACCATAGTTGACCTTTAACTCCAGCAGTTTCACCC
CACACAACGTCCATTCTTCTAGCCTTTCCTAGTGCAATGCGTGTATAGAGTCTCTGCCGTTGGTATCGATTTTGGAGAAGCATTGCTACTCCTT
GCATGATTGCCCATCTCAAAAATAATTGTATACCTTTCTGCTTCTGGGCACAGTCAGGTTGCCTTTCTATTTCCCAAGTGAGGCTGATAAGTGC
CATAGCCATAGCACAATAATGATGGTATATCCACCATGGACGTATATCGCTTCCATTAACTCTCAAAATATTTTCTCTTAAAGCTAACCCAGTG
TAGAGAAAGAGCAACCACGCCTGGTAAAGCTGGACAGGTAATGCAGGGAAACATCCATCCCAAAGCCACGATCTTAACCCCAGTAGCAGTGATG
GAAAAATCAGAAACAGATATGCAGTTCTATCTCTGAAACTATAGTATTCCTCCTTCACTTTCAATTGAACATCCTTTCTGTTAGCACGGACATT
TATTGGACCAAGAAACATTCTCAAAAACCTTCCATGTGATTTACAAGGAAGAAAAGTAGCAGCATCTCCTTCACTTAATGTATAACTTGCTCTA
CTTAAATCTTCACCCAATTTATCTGCATGTTTAGAATCCAAAGCCCCTTTTTTAACTTCAGAAGCAATAAAAGACTTGATAATCTTGATATTAG
AATCAAGAGCTAAAGCTCGTTGTCTTAAAGAAGCTTCTTCAATTGAATTTTTAGATATTAAATTCGACGCTGATTCTTGTAACTCTTTACTTTC
TTCTATTATTCTATTCACTTCTGAACACACGTCCCTATCACTATCACTACCACCCGTTGTTGTTGTTGTTGGTGGTGTTGTTGAATCGCCCATC
GGTAATAGATTTGATTATTTATATGTGTGTGTTTTTTGGTGTTTTTTCCGGCAGGCGG

Primers for UN82220 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1AGAATCCAAAGCCCCTTTTT 59.06820TCTATTACCGATGGGCGATT 59.39220259 10671325
2AGAATCCAAAGCCCCTTTTT 59.06820AATCTATTACCGATGGGCGA 59.39220261 10671327
3AGAATCCAAAGCCCCTTTTT 59.06820CTATTACCGATGGGCGATTC 59.39220258 10671324