Simple sequence repeat (SSR)
>UN04903 GTCCTGCCTTTTAGTATATACGAGTGTGGAAACGCGCGCGATGCAGCGGGATTGCTTTTGTAGACGTGAATTTGGATAGGGATTATTTTTGTCA AATTGCTTTTTTTGCCAAATTGCTAAAGATTGCAGTTAATGCTTAAGGACTTGCTTTGCAACGATATTTGAACCTCAGGGGCTGTTTTTGCCAA ATTGTAAAACTTGGCATTTAATGCGTGCCTAGTGTGAACAGCATTTAATGTTTGTGTGTGTGTGAAGCACTGTTCACGTCTTGCCTAATAGTAT AGTTAGTAATGTGCTTCTACTGTTTGAAGTTGGATAATCATATAATCAACTATTTGACTGTTTGGAAAGTTCTGATTATATAAGGCATTAGTAA AAAGGGTCCCTAAATGATCATCTAGTATGAAACTTATTATCCACAACTGTATTTGTATGCTACTTGGAAACTTAATAATCAGATAATCACATTA AAATCAGATTGCCAATTT |
Primers for UN04903 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GGCTGTTTTTGCCAAATTGT | 59.982 | 20 | GGGACCCTTTTTACTAATGCC | 58.876 | 21 | 213 | 174 | 386 |
2 | TATTTGAACCTCAGGGGCTG | 60.066 | 20 | GGGACCCTTTTTACTAATGCC | 58.876 | 21 | 228 | 159 | 386 |
3 | AGGACTTGCTTTGCAACGAT | 59.882 | 20 | GGGACCCTTTTTACTAATGCC | 58.876 | 21 | 247 | 140 | 386 |