Simple sequence repeat (SSR)
| >UN81713 CTGCTATCAAACTACATACAGTTTTATTATGGTGTAACATTTTCCCTTTTATGTTTATTGTTTAACATGAATAAGATATAAAAATAAAAGCAAG AAAACTTATGAGCTTCTTGGTAGAATAATGGCCTAAAAAAGTATTTAAGATTACTAAGTACCTTATAGACAAGTAACTAATAATTTAACACCCC CCAAAGTCTCTAACTGAAAAAGAATCTTTCTCCGGTATGTTTCCAGCATGGCGTAACCCTAACGTGAGTGACACGTCACCAGTATTGGTACCAA AACTTATTAGAGTTGAACCCATGTCAGCATCAGCCTGGAAAGATGGTGGAACAATGGATGTATTTCCAGGGTATGACATGGGAGAAACTTGGTT TTCTGCTAAGCATTTTTGCATATTAATTGCATGGTTCGATGCGTCGTAATCAGAGTCATTGATTTCAGATCTTTTAGCAGATGTGGGTGTGGTG GCTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGAGGCATAGAAGTTTGTGCTAGTGCAGAAGAAGAAGATGATGATGAGGGACCATTGGTTTGGTGTTGTTGGT TATTATTGTTGTAATTAATGTTGGTGTCTGATTTATTATTTTCTTGTTGATCAATGATATCTTGGTCTTCATCTTGTAATTGATCACCTAATTC TTCTTTGCCTTCTTGTTGGTACATTTCTTCTACCATGGGTTTCCACAATCGGACCCTTGCATTTATGAACCAATTTGATACCTGGTTTCTAGAT AGCCCGGTCTGTCGAGCCAATAAATGTTTATCAGCATCACTTGGATACGGGTGTAAAAAATGCTCGAAAAGCCAAGCTCTCAAGATGTTAACGG AACGTTCAGGCAAACCTCTTTGGGGTCTCCAAGCTTCTTGTTCCATCATGCCCATTTGATGGAATGCCCTTTGTTGTCTCAAGCTTTGTTCCAA CAACTTAAGCCTTGGAGTTTCACCTTTTGTAACCCCGGAAGAGCCAGCGTCTTTCTCCCCTAATAATTCACAGCTATGCTTCAATTGGGATGCT ATTGCATCTTTCAGACACCGAAAATGGCGTGACATGGCCTTTTGTGCTAATGCCGTGTATGGCACTGCCGCCCCAAACCCCATTACAAGATCAA ATGAGTTCACCACCATTTGCATTTGTTCACAGTAGTGATTGTATCTCCGATCCACCTCATCGAGCATGGTCGAAAGTTTGACCTTTCTTCTTTG ATGTTCAATCCTTTCTGCTGATGATAAGGGATGTAAATCTTTCGAAGAAGAAGATTCACCACCACCACCACCGCCTTCGGTTGGATTATTATGT TTTGAACCGGATTTATTTTTCTTGAAATTGCCTCTTCCAACACTACAAAATTCTTCAAGCAACTCTTGAGCTGGCTTGACATATCGCGAATTTC GCAACACTTTAATACCTCCTAACGAAGAGGATCCGAAGCCCATATGGATAGGATGATGTGTTTGAATTTGTCCCATAACACCACTTGCTCCTTG CATATGCATATTCCTGTAAGGATCACCACCACCAACACCAACTTGGTTAAAGTACAACATCCCACCGGTACCAGAATCGTCCCCAATTCTCATA TCTTCGACTTTAGTTGCTTCTAGGTGTTGTAAAGATGAAGATAACGAAAGCGAAAGACCTTCAACACTACCACCGACACTTTCAGCTTCATGAG ATGTAGCACCAGGAGGATTAACCCAAGAGAATTGTGTAGATGGACCAAAATGCCCTTGTCCAGTACTCGTTGTACTACCAAAGCTTTGTTGATG GTGAAGGGTAGGACTGGTAGATGGGACAGTATTTGGTAGTAACATATGAAGCTGCTGGTGGTGCTGATGATGATGATGAGAGGGAGACTCGGGT GATTCGTGTGAAGGGTTTGTTAAAAAAAGTTGCATGGCTTGAGCTTGAGCAGTAGTGTTACCATACCAATCTGGCCGATGATTATTACCTTGGT TTTGTTGATGGTAATTTATCTGGTTCATCAACAATTCAGAAGCCGAATTGGTAATGGATCCGCCTGTTGGGAAATTAAACATTTCAGACAACAT ACCTGCTCCTGACTCGTACGGTAAACTAGGGTGTCCCTCATCCACTTCTTCTAGTCCCAACGGTGGTGGTGGCTCAAACCCTTGTATTCTAACC TTGTTATCTCTGCGGATCTGGTCTTGTGGCGATGATTTCTCGAACCCATGTGAGAAATTGAAAATATAATCTTGTGACATAGAATTCAGAAGGT GATACTAGTACTTTTATAACCTCAACTGGTATTGAAT |
Primers for UN81713 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | CACCGACACTTTCAGCTTCA | 60.025 | 20 | AGCTCAAGCCATGCAACTTT | 60.022 | 20 | 257 | 1669 | 1925 |
| 2 | ACGAAAGCGAAAGACCTTCA | 59.993 | 20 | AACCCTTCACACGAATCACC | 59.827 | 20 | 256 | 1642 | 1897 |
| 3 | CACCGACACTTTCAGCTTCA | 60.025 | 20 | AACCCTTCACACGAATCACC | 59.827 | 20 | 229 | 1669 | 1897 |