Simple sequence repeat (SSR)
| >UN81713 CTGCTATCAAACTACATACAGTTTTATTATGGTGTAACATTTTCCCTTTTATGTTTATTGTTTAACATGAATAAGATATAAAAATAAAAGCAAG AAAACTTATGAGCTTCTTGGTAGAATAATGGCCTAAAAAAGTATTTAAGATTACTAAGTACCTTATAGACAAGTAACTAATAATTTAACACCCC CCAAAGTCTCTAACTGAAAAAGAATCTTTCTCCGGTATGTTTCCAGCATGGCGTAACCCTAACGTGAGTGACACGTCACCAGTATTGGTACCAA AACTTATTAGAGTTGAACCCATGTCAGCATCAGCCTGGAAAGATGGTGGAACAATGGATGTATTTCCAGGGTATGACATGGGAGAAACTTGGTT TTCTGCTAAGCATTTTTGCATATTAATTGCATGGTTCGATGCGTCGTAATCAGAGTCATTGATTTCAGATCTTTTAGCAGATGTGGGTGTGGTG GCTGGAGGTTGTGGTGGTGGTGGAGGCATAGAAGTTTGTGCTAGTGCAGAAGAAGAAGATGATGATGAGGGACCATTGGTTTGGTGTTGTTGGT TATTATTGTTGTAATTAATGTTGGTGTCTGATTTATTATTTTCTTGTTGATCAATGATATCTTGGTCTTCATCTTGTAATTGATCACCTAATTC TTCTTTGCCTTCTTGTTGGTACATTTCTTCTACCATGGGTTTCCACAATCGGACCCTTGCATTTATGAACCAATTTGATACCTGGTTTCTAGAT AGCCCGGTCTGTCGAGCCAATAAATGTTTATCAGCATCACTTGGATACGGGTGTAAAAAATGCTCGAAAAGCCAAGCTCTCAAGATGTTAACGG AACGTTCAGGCAAACCTCTTTGGGGTCTCCAAGCTTCTTGTTCCATCATGCCCATTTGATGGAATGCCCTTTGTTGTCTCAAGCTTTGTTCCAA CAACTTAAGCCTTGGAGTTTCACCTTTTGTAACCCCGGAAGAGCCAGCGTCTTTCTCCCCTAATAATTCACAGCTATGCTTCAATTGGGATGCT ATTGCATCTTTCAGACACCGAAAATGGCGTGACATGGCCTTTTGTGCTAATGCCGTGTATGGCACTGCCGCCCCAAACCCCATTACAAGATCAA ATGAGTTCACCACCATTTGCATTTGTTCACAGTAGTGATTGTATCTCCGATCCACCTCATCGAGCATGGTCGAAAGTTTGACCTTTCTTCTTTG ATGTTCAATCCTTTCTGCTGATGATAAGGGATGTAAATCTTTCGAAGAAGAAGATTCACCACCACCACCACCGCCTTCGGTTGGATTATTATGT TTTGAACCGGATTTATTTTTCTTGAAATTGCCTCTTCCAACACTACAAAATTCTTCAAGCAACTCTTGAGCTGGCTTGACATATCGCGAATTTC GCAACACTTTAATACCTCCTAACGAAGAGGATCCGAAGCCCATATGGATAGGATGATGTGTTTGAATTTGTCCCATAACACCACTTGCTCCTTG CATATGCATATTCCTGTAAGGATCACCACCACCAACACCAACTTGGTTAAAGTACAACATCCCACCGGTACCAGAATCGTCCCCAATTCTCATA TCTTCGACTTTAGTTGCTTCTAGGTGTTGTAAAGATGAAGATAACGAAAGCGAAAGACCTTCAACACTACCACCGACACTTTCAGCTTCATGAG ATGTAGCACCAGGAGGATTAACCCAAGAGAATTGTGTAGATGGACCAAAATGCCCTTGTCCAGTACTCGTTGTACTACCAAAGCTTTGTTGATG GTGAAGGGTAGGACTGGTAGATGGGACAGTATTTGGTAGTAACATATGAAGCTGCTGGTGGTGCTGATGATGATGATGAGAGGGAGACTCGGGT GATTCGTGTGAAGGGTTTGTTAAAAAAAGTTGCATGGCTTGAGCTTGAGCAGTAGTGTTACCATACCAATCTGGCCGATGATTATTACCTTGGT TTTGTTGATGGTAATTTATCTGGTTCATCAACAATTCAGAAGCCGAATTGGTAATGGATCCGCCTGTTGGGAAATTAAACATTTCAGACAACAT ACCTGCTCCTGACTCGTACGGTAAACTAGGGTGTCCCTCATCCACTTCTTCTAGTCCCAACGGTGGTGGTGGCTCAAACCCTTGTATTCTAACC TTGTTATCTCTGCGGATCTGGTCTTGTGGCGATGATTTCTCGAACCCATGTGAGAAATTGAAAATATAATCTTGTGACATAGAATTCAGAAGGT GATACTAGTACTTTTATAACCTCAACTGGTATTGAAT |
Primers for UN81713 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TCACCACCATTTGCATTTGT | 59.823 | 20 | CGATATGTCAAGCCAGCTCA | 59.972 | 20 | 268 | 1135 | 1402 |
| 2 | TCACCACCATTTGCATTTGT | 59.823 | 20 | AATTCGCGATATGTCAAGCC | 60.067 | 20 | 274 | 1135 | 1408 |
| 3 | CCACCATTTGCATTTGTTCA | 60.357 | 20 | CGATATGTCAAGCCAGCTCA | 59.972 | 20 | 265 | 1138 | 1402 |