Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN81216
GGATGTTTTACACTGAAATAGAGGTTGGATGCTTGAAATTCATAGTACCATTTAACCAGTCACTACTTAACATTGTAGTACATTTAGACATTTA
GTCATTTACAACGGTCAATGGAACTTTTTTTTATCAAACCTGGAGATATATGTTGATTGGTAAAGGTTTATTACGAGGGGGAGTTGTAGAGTGA
CAATAACTGAAATCGGCAAGCAAGCAAATAGTCCTATTGGTGCTAGCATCCATGGTCTTTGATCACAAAAAACAAGGAACAAAATTGCACCAAA
GGCTACCATCATTGCAGTTGTAGAGATGAATAATGCACAGAGACCTAAAATCAACCGTCTCGGTAAACTGACCAAAAAATCCTTTTCCGCAAAT
CGTGTAGTAAGGATAGATAAAAACACTAATAGTGCAGTAGCAGCTGTAAATAGTGAGAGCGCGTCACATACTGCAAAGATAGTGAATGCGATTT
CTTTCTTAAACAAGGGGATTCCCGTTTCTTGGTTGCTTCCCCCTGGTACAGTTATAGCTGCTGCAAATACAATCGTGACAATTAAAGCAGCCGT
GATGCTACATGATTCGGCAGTGGTTTTCATCCACTGCTCCCCATTCTTCAGCAAATTCGCATGTTCCCTTGTAAAGACCATGTCTGACGTCTCC
ATATCGAAATTCTTTTGTGTAAGTTCAATTGGGTGCATGAGCTTCTTCACTTCCTCATGCCATTGGAGCTCTCGCTGTAATTTCAGTGCTGCAC
CTGTAGCACGACTCAGTACAATTGAAGATGCCGATTTTGCAGCCAAGTGCGTTAGCCAATTATCTGAACCATCCCGGTCGCTTCTCAGAGAATC
ACTATGCTTAATCCCGGGATACAAACGGTTGTATACTTTTTCTGAACGGTTTAATATTGCTAACTGGAAAACATTGTGCCCTCTTTCATTCCTA
CACAACTGGGCGTATTCGCAACCACGCAGAATCTGAACAACCACCTCGCAAGCATCCACACGTGCAGCCTCTAGAATTGGTCGCCCGTAAAGCT
CCTTGACATTTTCAGGTGTGACCTTCTTGTTCATTTCATCACATATCCGTTTTAAAACTTTTATAGCTTGTTCATAGTCTCTTTTTTTCTTCTC
AATGTGCTTCAATGGAAGCCCTGCATACACTAAACCTTTCCATAGGTGAGGATACAGCATAAATAAGGGCAAGAGAAGTACAAAAATGACGATA
CGGATCAGTAGATATATCAAACAAAATACAGCTACTGGGACAAGTAATATTAGCACAATAAACAGCAACAACCATCTGAGGTACGTGTTTTTTA
GGTTTCTGATTGCCCACAAGATGCCGTGTGCCTTAATGTACAAATTTTCAAACGAATACAACAAAAGAGAGCTTCTCTTGACAATGTTCTGACG
CACACCATCTGTCGTCGGATAGATCAATGCTTCCCAGAAGCCAAGCTCATGTGGAAAGTTAGTAGTCAATGCCATCAACGCAAAATCACCTTTG
GTAGCCAAAGGCAGTAACTCAGGTATCTCGACCAACTTCAATGCTAAATTGTATTGTTTTGTGCTAGTAGCTTTAGCAACAAGACGGTGGACAC
CTAGACGACTCGCATTCCTGGAATGAAGCCACCCCTGCCCGTCTCTAGTGACTCCAAGTAAATATAAGAATGTATTGATCTGGCCACTGATATA
AGCTAAAGCCAATGGTGTGTTGCTCCTATACTTTGACACATACAACAGTTTGTTACTCTTATTAACCAAGAGTTCGGCCGCTTGTTTATTGTCG
ATGACCGCAGCGGTGAAAAGGGCTGTATTGCCTTCTGAATTCCTATGTTCTAATAGTTTTAGTATTTTACTTCGATCTTTTATGAAGTTGAGCA
ACTGATTGACAAAATAATCTTTGCCTTCCTTAACCGCTAAGTGGAGCATTGTGTCACCATTATTGTTGATCACCTTAGTGGCTGCACCTTTATG
GTTTTTTAATATGGCTTTTGCTTTCCACCAACTTCCCTCCATGGTAGCATTCAGCAACTCCTTCATGAGTTCAGTGCTTTCTTTGTCATTGAGT
TCGGTGCTTTCTTTGTCGTATGGTGATACATCCATGAGCATTCGTTCTGTGATCTTGGTTTCTTCAGTCGAAACATGTATACAACAACAACAAC
ATCTCATCTAGTCGAAACATGTACCAGTCGAAACATGTACAATTGGGTTATATAGA

Primers for UN81216 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTGGCTGCACCTTTATGGTT 6020TTCGACTGGTACATGTTTCGAC 60.03722237 19582194
2TATGGCTTTTGCTTTCCACC 60.07420TTCGACTGGTACATGTTTCGAC 60.03722211 19842194
3TTTGCTTTCCACCAACTTCC 60.08820TTCGACTGGTACATGTTTCGAC 60.03722204 19912194