Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN80983
ATTGTCCGACATTAAGTCAACCAAGTGTCACTTAAATGGAAAAAACATAAATTTATAATACAAATAATCACAAACATCCTTACAAGGCCAATTA
TTTATTGTAAGTAAACACCAACATCACAATTCACTTTTGACCGTTTAATTTGCATCTAGTCACACTTGTTTTTAACTAATTAATGTGGCGAAAG
AGCACCATAGCTTCGCCCTAGTGGAGAGCGCGCTGGTGCCAGTTCTGGCGTCAACGTTGTCCACTGCATATCCGAGGACTCCAACTCATTACCG
TAATACCCTTTGGAACAAGGCACATACGACAAAGACTTTTCATCCGGACACGAATGAGGAACCGAAAAGTACTTAGCACATTCGGCAGGCGATC
TTTGGTCAGGAAGATCCAAAATGCAATTCATCTTCACATGAAGAATCCCGTCTTTAATCAGCTTCCTACACTTCTCACCAACTTGGGTAAAATA
ATTATACGAAAGGGTAAAATTCGACAAATTTGGTAAGCTACAAACCGCCTCCGGTACAATCCCTGAGAAATTATTATGAGCCAAATTTAGTAGC
TCCATTTTCTTTAAACATTGAAACGAATGAGGGATCGGACCCATTAACTGATTAAAACCAACATCAAACACCGTAGCTTTCTGCAAAAACCCGA
TTTCATAAGGCAAACAACCAGTTAACTGATTGTTCAAGAACAAAACCTCGAGTAAAGTATCCTTTGTTAAGCCAATACTCTTAGGTATCCCACC
AATAAATTTATTATTTGCCAAGACTAAATAAAGCGCGGTCGTGGCTCCGAGGTTTTCGGGAATCTTTTGGACGAAGTTATTGTTGTTTATAAAT
AGCAAGTCGAGGTCAAGAGTGAATATTTGAGGTGGAACAAAGCCCGCGAAGTTGTTGAACCGTAGGTCGAGAAAAAGTAATTTTTTAGCAGCCA
GGACTTCGTTCGGGAACTGGCCCGAAAGTTTGTTGTTACTAAGGTCGAGTTCGAAGAAATATCTTAGTTTGCTAGATTTGACTGGGATGGTACC
TTTGAAGTTGTTCGAATTTGCATGGAAGAATACTATGTCTTCTAAACCCAGGAGGAGTTCGTTTACGGTTAGATGGCGACCAGAAAAGTTTCGG
TTGTTAAAGTTAACGCCTGCTAATGTTCTTTTTGTTTGCCCGGGTGCATAGTCGCATGTGAAGCTGCCTCCGTAATTGCAAACATTTTTACCCT
TCCATTTTTTGAGAATGCCTGTGGGATCTCCTTCTATTTTCACTTTGAATCTCGTGATTACATTGTAGGCTATTTCGAGTTGTGGACTCTCGAA
TTGACTCGATGGTGGTTTTGGTGATGGTGGTTTTGGTGAGGGTGGTTTTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGATATTTGTGGAGGTATAGGTGTTGGT
GGGTGGGGAGGGGGAAGT

Primers for UN80983 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ATGTTCTTTTTGTTTGCCCG 59.97520CCACCAACACCTATACCTCCA 59.7221262 11511412
2GCCTCCGTAATTGCAAACAT 59.96720CCACCAACACCTATACCTCCA 59.7221219 11941412
3ATGTTCTTTTTGTTTGCCCG 59.97520CCCACCAACACCTATACCTCC 60.48221263 11511413