Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN04599
GCATACATAAAAATCGTGGAAATCAAATCATTGTATCATGATCTGATGATGGAAACCTATACGGGGTATTATTCCATTCACTGCTAAACTTTAT
GTAACAAACAAACAAACAAAAAAAAAACCAAAACATGGCCTATAAATGCGCTTTAAGATGATGATGATGATGATATGGTATTCATTAAGACTAT
AAATGCGCTTGAGAAAGTAGTTGCTTATTTTACATGATGGAGCATCCTTGTGGATTATCTTCACTGAAGCAATCACACCTACTGACATAACATG
GCCTGTTTGGTGGATATTGGTACCCATAATAGTCGTAGCACGGTGGTGGGGGTACAGGCCTTCCATAGCCATAGTGACATGGACCTCCATCCCG
GCCTTCATAGCACTCTTGGCAACAAACGGAAACGGGTGGACGGGTAGGAGTGTCAATTTGTGTTTTTGGTGGTGGTTTGGGTTTGGGTTGTGGG
TAGGGCATGATGGGTTGTTGGTAGGGTTCGGGTTGAGGTTGAGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGTATTCTGGGTTGGGG

Primers for UN04599 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TGATGGAAACCTATACGGGG 59.6420AATATCCACCAAACAGGCCA 60.19220254 47300
2TGATGGAAACCTATACGGGG 59.6420CCAATATCCACCAAACAGGC 60.19220256 47302
3ACATGGCCTATAAATGCGCT 59.59720CCAATATCCACCAAACAGGC 60.19220176 127302