Simple sequence repeat (SSR)
| >UN79431 TTCGTTAATCGACGATTTATTAAAGCGTTTGACAAGCCAAACTTTCTCCGTGATAAACAAAAGTGAACGCTCGTTAAACATGGGACACAATCAA AGTAATATTGTCCCTCACTCCAAATCTACATATAACTTGTTTTTACAATTCTTGAACCAAGTAATTCCTTCATATACTCTATACAAAACAATCG CAAAGTGTTCCTTATGGATCACAAAACAATGGAGCATAGTGTCCGATATATCATAAATGTTTTATTTTTTTTTCTGACAACCCGTTTAGCTTTT TAGCAACAACAACAACAACAAACGCCCAACCAGCAGATCAAAATGTAAAAACCAACAAACTGGACTAGAGACATGGCCTCACCAGATGGGCAAA ATACTTTGCAGGATAAAAAGGGTCAAAGTAATTTACGCTTGCGTTTCATGATACCTTCTGGCTGTTATTTTCTCCGGAGGTGGCAGTGGCGGTG GCAGCAGTGGCTGAACGTGATGCCTGGAGTTGAATGGTGAATTTCTTTTGCAATTCTTTAAGCTTATCTAGTATTTCTTGGAACGTTGGTCGGG ATTGTGGTTCACTGCACCAACAGCTTTCGATGAGAGAAGCCCATTGGGGATCCACATCCTTCGGAATATCTAGCCGTTGATTCATAAACCCTAC AGCTCCTATGACCTGCATTGAGTTAAGAGTATCCCAAGGGATCTTCTCGGTGGTAAGTTCCCATAATACCACGCCGAAACTGTATATATCGGAC TTTTCATCTGCCTGTTCATTCCGAAGAACTTCCGGAGCCATCCATTGAGGCGTTCCCTTCCCTGTCTTTGTGGTAAGATATGTTTCATGCTTAA TACGTGAGAGTCCGAAGTCCCCAACCTTCACATTCCAATTCTTATCAACAAGAAGATTTGAAGACTTCAAATCCCGATGAATGATAGGTGGGTG ACAATGATGAAGATAATTCATGCCTCGTGCTATGTCCATGGCCATATGAACACGACGTCTCCAATCTAATTTAGTTGTATTCCTTTGAAGTAAT CGAAACAAACTTCCACGTGGAAGGAACTCTGTGACAATGCAAAGACGCTGAGGTGAAGTTACGGCACCCATGAAGAGTAGAATGTTGGGATGCC GGAGCCTTTTCATGAGAGATACCTCCTGTCTAAACGATAATATCACATCATCAGAATATTCTTGCCTTGAGAAAACCTTGATAGCAACATCCGA GCCATACCACAGTGCATGGTATACTGTCCCACATGAACCTTGGCCAATTTGTTCTCCAATTATTAGGTCTTCCCACAAGATTTCATAATCCAAG CTATCAGTATCCATGTCCGCTTTATTAATAGCACTACTATTTGTGCTACCACAACTACTAGCGCTACTTGTGCTATTGACATTAAACGAAGAAG ACCATGACCCTGAAGCCTCGTTCCTATTTGTGTTTTCCCACGGTTGATTATCTACTTTAGATGAACTCGTTTGCTGACCAGATTCATGTTCTTG ATCATTATTTAACCAATGTAAACCAAACCGACCCACTTTTGAATCGGATGAAGTTGAACCACCTTCTTTTTCGCTTCCTTTCCATGGCCATGTA ATTCCCTTTTTACCCATCCATGCCTCAGCTTTTGAAGATAAAATCTTGTGAATTCCGGGTTTATTTTCACTCTCGTCGCCGGAATCGGTTGAGG GTTTTACAGTAAATGGTGATTGAGGAATATCGCCCCTTGGGGTGCTGGCTCCACTTGAATATCCATCTTCTTTATGATCAGGGCCATTAGCGTC ATTTTCGGAATAATGACTGTCTCCACTTGCAACATCATGATCCGTGGAGTTTTCTCCGTTTTTCATTTTTGATTTAACCTTGTTGCTAACTTTT GTGGCCAGATTGGAAATCTTCGAGGCGATTGCAGTTTGTAGAGGTTGTTGAGGATCAAGCCCAAGTTTAGCCGAAGCAATCCTCCGAGGTGCAC TAATATTCCCCAGTGACTTTATTTCTCTATATGGGCGTGTATCACTAGATACACATATAACCCCAACTAATGTTCCATTTTCATCAGGAAAAGG GGTAAAATTGGCTATAATTTCAAATCTTTCCCCTCGTTTGTTCTTTATTGGAAACTGCCCAGACCAACTTTCCCCCCTAATAGTTCTTTGTAAA ATAGCATCAGCTAACGGAATATCGTTTTTTTCTACTAGAAGCTCATTGGGTGATCTCCCTAGAGCTTCTGCAGCCTCATAACCATAAAGATTTT CAGCCATACGATTCCAGTAGATAATGATCCCGTCGAGGTCAAATATATGCACAGATTGACCCATTGACTGCAATATATTCAAATACTGTGTTTC CGTTAGCTTCACAGCTGAAGGCCCACGAATTAAACCACTCTCCCTAGTAACACCACCACTGCTATTACCCAAACTATTCTGATTATTATCATTG CTGTAACTAACATCAACACTGCGAGTTTCTCTCCTCAAAGGCGACAAATGCCGAAAAGAAGCTGAACCCATTTTGAAGGCCGCCACAGCGCCAC CCTCAAACGCCCCACCAGCCGTGCCCATAGTTCTCCTACGAGGGCGCCTAGGAGATACTGAACTAGACCTTTGCCGCTCGACTCTTTGCTGCTC ATTGGATACTGTTAACTTTGACATTTCTTGTTTAAGATGAGCATGACTTTCTTCTAACTCATGAATCTTTTTTAATAGCTCCTCAGTTTGCGGT GCTTCATTCTTGTTGTTGTTTGTATCCATTTTTCACACACTTTCACACAAATACACACACACTGTAATTTATGTATCAAAAAATTGTTCCTTTC ACTTCTTTAAGCT |
Primers for UN79431 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | CAATGGAGCATAGTGTCCGA | 59.673 | 20 | CCGGAGAAAATAACAGCCAG | 59.702 | 20 | 239 | 215 | 453 |
| 2 | CAATGGAGCATAGTGTCCGA | 59.673 | 20 | TCATGAAACGCAAGCGTAAA | 60.39 | 20 | 213 | 215 | 427 |
| 3 | ACGCTCGTTAAACATGGGAC | 60 | 20 | CATTTTGATCTGCTGGTTGG | 59.123 | 20 | 261 | 67 | 327 |