Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN77837
TTTTTAACCTAAAAAACAAAGTACTCCAAAAGATGTTCTTGTTTACTCAGCCAAATAGGTCAAACAGAGGATAGATCAGCATATACATGATTAA
GAATCTTCATCCTCATATTGTTTCCACATGAAAATAAAATAAAAAACTCACTAGTCCCGCAACCCTTTCTTTACAACCATAATATTACTACTAT
CAAGAGATCAATTTAACCATAACAGACCGATTACCAACTCAGAATCAAAGTCTTGGTCTTCATATAGATTTTACCTAATCCGTCTATAATTAAC
ATTTTACTTCATACCCTTAAAGCCACAGGATCTTGCCATGAGATCTTCCTCTTCCCTGATCGATTTGTTGAACCATCACCAACATTTCTACACA
ACGATAGCTTTAAATCATTGTGTAGGTCTTTCCTTTGGTCTTCAACGATCTCTTGCACTTCTTCTTCTTCTTCTTCCATTGATATCTGGTTCAA
GTCAAATATAGGAGCTCGTGTTTGCGCCGAAGTTTTTTCACCACTGAGACCACTTGCTTTTTGATTAAATTCTGGCATTGGAGATGAGTTGTTT
CCATAGACCATTTGGTTTAGATTAATACCATACGAACTCACATTTTGATCCACGTCAAACATGGGATATGGTCTAATTGGAACGATGTTTTTCT
TCTTTGTAAAATCTTTTCCCCTTTGGTTAAGGTTGGGAACCAGGAACAAATTAGGTAAAGCAGCCGCCTTTGTTGGATTAACCTTCTCTTTTTT
GCTTTTCCTGTATTGGGCTGTTTCTACATTCTGCGATTTCACTAGCTGTGAAGTCGAAGACTTGGTTTTCATTAGAAATTTGTGTCGTCTCCTC
AAGAATCTAACTTCAGCTTCGAGAATCTGTTTCTTTTGCTTCATAAACTCCACATAGCTTCTTGCAGCCTCAGTTTCCTTTTGCAAGTGAAGAT
AATCTTGAACAAGGGTTTGATGCTTAAACCTTGCCTTAACATCTTCATAACCAAAAGCAACACCTTTCATCTTCTTCATATTAGTACTCATCAT
CAGATCTTCTTAACAACAAAAAA

Primers for UN77837 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TAAAGCCACAGGATCTTGCC 60.21420GCAAGTGGTCTCAGTGGTGA 59.87220228 300527
2TAAAGCCACAGGATCTTGCC 60.21420CAACTCATCTCCAATGCCAG 59.24120262 300561
3TCCCTGATCGATTTGTTGAA 59.04920GCAAGTGGTCTCAGTGGTGA 59.87220193 335527