Simple sequence repeat (SSR)
| >UN77656 CTCGTATGTCCAGTATGAAAAGAATACAAACCATTTTATAATTGTTGATTGTGGAGAATATCTAAATAATGAGCACAAAGTCAGAGTAACAAAC CACTCTTTCATTTTCCAACCCTAAAACATAGTTTGTAATATACATGAACTTGGACTTACTTAGACCCTACATAAACATTAAAAAACATATGGGG TCAAATAAAACACCCTACTAAGATAGTCCAATCTGAACAACTGTATGAGCCGCGGCCGATGCATGACCAAACTGAGTTTGAGCCTGCATAATCT TAGCATCTATTGCTATCCGTTCGTTAGGCTGTTGGCTTGACATACCATGTTGATGCACATGTGCATGCGGTTGGGTGTAATACGGGTTACTATT AAGGTCAATTACTATACCCCCTGCCAATTTTGCTGCACCAGTTTGCTGGTGCATTTGTGGGTGTGGGGCCATTGAAGACGGACCCCTAACAGGT TCTACGCCGTTAAATGTCCCTTGATCTCCACCGTTGTTTGTCATATATACATATTGTGGAGGGGCTACTGTATTTTTCACTAACGCCCTTGGAT CATACACCTCTTCGTAAGGGAGAACTGGACCTATAACTCTTCCTTGTTTAACTGTGGGCATTCTGGGGGGTGGTCGAGTAGCAGCAGCAGCAGC TTGGTAAACGTTTCCAGATGCATCTGTTACTCTACCACTACTAATTGTATTATCTATCACTCGTCTATTATCAACTGTAACTACAGTCTGTTGA GGTCTAGAGGCAATCATACTTGAATTGACCGACGACCTTGGAAGGGAAGCATGCTTACGCTCAGGGGGGGTAGCAAGCCCACCTTTCCCACCAT TTTCCTCCAAATATGCGAACTGCCTACGGAATTGACCAATGGCACTAGGATATTGAAAGTTGGTGTTTTCGTTCCCGGCCATATAATCTTTTAA AAGTTGAGGATGGTATTCAAGAATCTCCCGAAATATTAGTTCCCGGATGTCCTCCTTTGTCACCCTACGCCTCTCGAACTCAAACTCGAACTTT GAGATCGACTGACAAGAAGGCTCCCTCTCGAGCTTCGCCAACCCCTTGAAGTAAGGATCTGCTAAAGCCTCTTCTGAACTTGGCCGATCCTTTG GATCAAACGATAACATCCTCTGCAGTAACCTGAGTGCTAACGGGTCGACGTTCACAAACTTTTGTGAAAATGGAACAGGTTGCTTTTTACGCAT ATCCATCAAGTATTTTCTTGCCTTATCATTACGAACTCCAGAAATAGTGTCTGGCGATGGTGTCCCAAGAAGGTCGGTGATAAGTTCCAACTGA TGAACGACACTTTTACCGGGGAAAAGTGGTTTCCCGGTCAGCACTTCAGCAAAGATGCAGCCAATGCTCCATATATCAATAGCAGGAGTATAAT ATCTCTATTCTCAAGAACCATGCTTTGGCCATGCAGCAGCATACATCTCTTTGAAGAAAAAGATCCACATAGCTCTGGTGCCCTGTACCATCTT GTTGCAACATAATCCGTCCAAAATATCGTTGTTGGTGTATCAGTAAATGCAGCCCTTGCAAGTCCAAAATCGCATATCTTTAGTTTGCAATTTG CATTTGCTAATATGTTCTTTGGTTTTAGATCTCGATGATACACATTTGCTGTGTGCATATATTTCAAAGCTCGTAGCATTTGATAGAGGAAAAA ACGATGGTGCTCGTGTGTCAAGTCATCGTTGGCCTTGATGACTTGGTGAAGATCAGACTCCATGAGTTCAAATACAACATAAATATCTTTAAAT TCCCGCCTTGATGGTGGCAACATGATCCGTTTAATTTCAACAATATCAGGATGGCGTAGAAGCCTAAGCAATTTAATCTCACGCAAAATTCGAA TAGCATCGGATGAATGTTCAAAAATGTTGGTAATTTTCTTTATTGCAACCTTCTCCCCGGTCTGTGTGTCAATGGCTGCACACACGACTCCATA ACTTCCCTTTCCTATAATCTCTAGGATTTTGTATCGGTTTGCTTCACCGTATTCAGTAAAGAACTCAATGTCTTTTGGACTCTTTTTCCTTCGA TCTTGCTGCTGCATCTCTCTTTCTTTATTAATTTCTCAAATACAAAATCAGATCAAAAAAATACAAAAAACAGATGGTAGAAATTTGAACAAGA AAAGAAAGCAAGTATTTTTTTAATAGATTAAAAGAAGAAAATCATCCACATTTGCCCCACCTACCACAACTACGAATAACCAAACCAAAATCCT CACAAATAAATCGTTTGACAACAACCAACTTATTCATCCACTTTTAATAAACCCTAACCTTATAAATT |
Primers for UN77656 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | CACTAACGCCCTTGGATCAT | 59.955 | 20 | GGTCGTCGGTCAATTCAAGT | 59.973 | 20 | 242 | 548 | 789 |
| 2 | TTTTTCACTAACGCCCTTGG | 60.103 | 20 | GGTCGTCGGTCAATTCAAGT | 59.973 | 20 | 247 | 543 | 789 |
| 3 | CACTAACGCCCTTGGATCAT | 59.955 | 20 | AGGTCGTCGGTCAATTCAAG | 60.111 | 20 | 243 | 548 | 790 |